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I joined the DAR team (Développement Adaptatif du Riz, CIRAD, Montpellier) to do my internship. This group works on rice root development and specifically on genes involved in ground tissue formation. Some mutants under study in the lab are affected in cell identity (supernumerary cell layers or mixed cell identity). In order to be able to distinguish roots tissues one from the others and to analyze carefully these defects, the team needed cells identity markers. This tool was not available in the laboratory. Therefore, my project focused on characterizing such markers. I tested three different approaches, all based on cell wall composition. The first two ones rely on spectral signatures oftransverse section of rice seminal roots, which are excited at various wavelengths, such as UV (cell autofluorescence) and IR (FT-IR). The third approach was to screen a library of 174 antibodies specific to cell wall components by immunohistolocalization. At this stage of the project, we can conclude that the more promising results have been obtained by immunohistolocalization. Indeed, we succeeded by this method in identifying root tissue specific markers.; J'ai effectué mon stage au sein de l?équipe DAR (Développement Adaptatif du Riz, CIRAD, Montpellier). Cette équipe étudie le développement de la racine de riz et particulièrement les gènes affectés dans la mise en place des tissus racinaires. Certains mutants étudiés présentent des défauts d'identité cellulaire (couches surnuméraires ou couches d'identité mêlées inconnues). Dans le but de distinguer les tissus les uns des autres et d'identifier ces défauts d'identité, l'équipe avait besoin de marqueurs d'identité cellulaire. Cet outil n'étant pas disponible au laboratoire, mon projet a été de caractériser de tels marqueurs. J'ai testé trois approches différentes, toutes basées sur la composition des parois cellulaires. Les deux premières reposent sur l'étude de signatures spectrales de coupes radiales de racines séminales de riz, excitées à différentes longueurs d'onde, telles que UV (autofluorescence des cellules) et IR (FT-IR). La troisième approche a été de cribler une banque de 174 anticorps dirigés contre des composés pariétaux par immunohistolocalisation. A ce stade du projet, nous pouvons conclure que les résultats les plus prometteurs ont été obtenus par immunohistolocalisation. En effet, nous avons pu identifier des marqueurs d'identité tissulaire par cette méthode. |
