Diversity of citrus gummosis in São Paulo State, Brazil

Autor: Urashima, Alfredo Seiiti, Mistura, Tatiane de Fátima, Gonçalves, Cassiara Regina Noventa Correa Bueno
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2016
Předmět:
Zdroj: Summa Phytopathologica, Volume: 42, Issue: 3, Pages: 209-215, Published: SEP 2016
Popis: Citrus gummosis is an important disease because it causes the death of young plants, resulting in their replacement, a costly operation. Its causal agents are different species of Phytophthora. Dissemination of these microorganisms occurs mainly by contaminated nursery trees. Differences in aggressiveness, competitiveness and response to fungicides varied among species of this pathogen. Therefore, this study aimed to examine diversity among citrus isolates of Phytophthora from two different origins in São Paulo State. Thirty isolates from citrus nursery trees from 13 municipalities and 11 from seven commercial orchards were analyzed. Interspecific diversity was performed by species-specific primers and sequencing of the ITS region. Subsequently, intraspecific diversity was carried out with 16 RAPD primers and clustering analysis of UPGMA, using the Dice coefficient. Our data identified only P. nicotianae from either substrates or commercial fields. Isolates clustered into two genetically distinct populations. Genetically similar isolates were also found. The existence of these clonal lineages among isolates from geographically distinct nursery trees suggests an efficient dissemination mechanism. This was the first study to examine the diversity of Phytophthora in citrus from substrates of nursery trees in Brazil. RESUMO Gomose do citrus é uma doença importante porque causa morte de plantas jovens, resultando em sua substituição, que é uma operação onerosa. Os agentes causais são diferentes espécies de Phytophthora. A disseminação destes microrganismos ocorre principalmente por mudas contaminadas. Diferenças na agressividade, competitividade e resposta à fungicidas variaram entre as espécies do patógeno. Portanto, esse trabalho objetivou examinar a diversidade entre isolados de Phytophthora de citros advindos de duas origens diferentes do estado de São Paulo. Trinta isolados provenientes de mudas cítricas de 13 municípios e 11 de sete pomares comerciais foram analisados. Diversidade inter-específica foi feita através de iniciadores específicos de espécies e seqüenciamento da região ITS. Em seguida, diversidade intra-específica foi conduzida com 16 iniciadores RAPD e análise de grupamento de UPGMA usando coeficiente Dice. Nossos dados identificaram somente P. nicotianae, seja em substratos ou campos comerciais. Os isolados foram divididos em duas populações geneticamente distintas. Isolados geneticamente similares também foram encontrados. A existência dessas linhagens clones entre isolados de mudas geograficamente distintas sugere um eficiente mecanismo de disseminação. Esse trabalho foi o primeiro a examinar diversidade de Phytophthora de substrato de mudas cítricas no Brasil.
Databáze: OpenAIRE