HIV-1 dynamics and coreceptor usage in Maraviroc-treated patients with ongoing replication

Autor: P, Recordon-Pinson, S, Raymond, P, Bellecave, A G, Marcelin, C, Soulie, D, Descamps, V, Calvez, P R, Harrigan, H, Fleury, J, Izopet, B, Masquelier, Theresa, Mo
Přispěvatelé: Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de virologie et d'immunologie biologique, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Virologie [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Numerical Medicine (NUMED), Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), British Columbia Centre for Excellence in HIV/AIDS [Vancouver], Laboratoire de Virologie, BC Centre for Excellence in HIV/AIDS, ANRS AC11 Resistance Study Group, Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Laboratoire de Virologie [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Toulouse], Service de virologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Unité de Mathématiques Pures et Appliquées (UMPA-ENSL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Le Corre, Morgane
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2013
Předmět:
MESH: Selection
Genetic
HIV Infections
HIV Envelope Protein gp120
V3 loop
MESH: Receptors
CCR5
Maraviroc
MESH: Genotype
MESH: HIV-1
chemistry.chemical_compound
MESH: HIV Envelope Protein gp120
HIV Fusion Inhibitors
Genotype
MESH: Sequence Analysis
RNA
Pharmacology (medical)
MESH: Peptide Fragments
MESH: High-Throughput Nucleotide Sequencing
MESH: Evolution
Molecular
[SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Genetics
0303 health sciences
education.field_of_study
MESH: Drug Resistance
Viral
High-Throughput Nucleotide Sequencing
virus diseases
MESH: HIV Infections
MESH: Cyclohexanes
3. Good health
Infectious Diseases
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
Viral evolution
CCR5 Receptor Antagonists
[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Receptors
CXCR4
Receptors
CCR5
Population
Viral quasispecies
Biology
Antiviral Agents
MESH: Receptors
CXCR4
Evolution
Molecular
03 medical and health sciences
Cyclohexanes
Drug Resistance
Viral
Humans
Selection
Genetic
education
MESH: HIV Fusion Inhibitors
Tropism
030304 developmental biology
Pharmacology
MESH: Humans
Sequence Analysis
RNA
030306 microbiology
Triazoles
Virology
Peptide Fragments
body regions
Viral Tropism
chemistry
MESH: Triazoles
HIV-1
Tissue tropism
MESH: Viral Tropism
human activities
Zdroj: Antimicrobial Agents and Chemotherapy
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2013, 57 (2), pp.930-935. ⟨10.1128/AAC.02159-12⟩
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2013, 57 (2), pp.930-5. ⟨10.1128/AAC.02159-12⟩
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2013, 57 (2), pp.930-5. ⟨10.1128/AAC.02159-12⟩
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2013, 57 (2), pp.930-935. ⟨10.1128/AAC.02159-12⟩
Antimicrobial Agents and Chemotherapy; Vol 57
ISSN: 0066-4804
1098-6596
Popis: There is evidence that HIV-1 evolution under maraviroc (MVC) pressure can lead to the selection of either X4-tropic variants and/or R5-tropic, MVC-resistant isolates. However, the viral dynamics of HIV-1 variants in patients with virological failure (VF) on MVC-containing regimens remain poorly studied. Here, we investigated the V3 loop evolution of HIV-1 on MVC in relation to coreceptor usage and the nature of HIV-1 quasispecies before MVC therapy using bulk population sequences and ultradeep sequencing. The majority of patients had no detectable minority X4 variant at baseline. The evolution of tropism was followed up until VF and showed three possibilities for viral evolution in these patients: emergence of preexisting X4 variants, de novo selection of R5 variants presenting V3 loop mutations, or replication of R5 variants without selection of known mutations.
Databáze: OpenAIRE
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