Caracterización molecular con marcadores SSR para 50 genotipos de arveja arbustiva (Pisum sativum L.) de la Colección GRICAND, Colombia
| Autor: | Oscar Checa-Coral, Jaime Eduardo Muñoz, Juan Diego Duque-Zapata |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2019 |
| Předmět: |
Genetics
Genetic diversity SSR markers grain legumes food and beverages estructura genética Locus (genetics) General Medicine genetic diversity Biology pre-mejoramiento leguminosas de grano Loss of heterozygosity Sativum plant habit pre-breeding Genetic structure Genotype genetic structure Microsatellite diversidad genética hábito de crecimiento Inbreeding marcadores SSR |
| Zdroj: | Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas, Volume: 13, Issue: 2, Pages: 208-218, Published: AUG 2019 |
| Popis: | The pea (Pisum sativum L.) is one of the more important legume crops produced globally. We studied the structure and genetic diversity in a collection of 50 pea accessions with 16 simple sequence repeat (SSR) mar kers, whose average polymorphic information content (PIC) was 0.62. The SSR markers amplified a total of 28 alleles with an average of 4 alleles per locus, with locus AB71 and D21 amplifying the largest number of alleles (6). The observed heterozygosity (Ho) was 0.09±0.08 and the expected heterozygosity (He) was 0.42, indicating an elevated level of inbreeding (Fis = 0.60). The genetic relationships were inferred with a similari ty index (DICE) and a bayesian analysis (STRUCTURE), detecting 2 clusters for the genotypes, with a high similarity of the morphological characteristics of each genotype. The results of this study will be useful for the creation of future breeding programs. RESUMEN La arveja (Pisum sativum L.) es uno de los cultivos de leguminosas más importantes producido a nivel mundial. Estudiamos la estructura y diversidad genética en una colección de 50 accesiones de arveja con 16 marcadores de Secuencias simples repetidas (SSR), cuyo promedio del contenido de información polimórfica (PIC) fue de 0,62. Los marcadores SSR amplificaron un total de 28 alelos con un promedio de 4 alelos por locus, siendo el locus AB71 y D21 los que amplificaron el mayor número de alelos (6). La heterocigosidad observada (Ho) fue de 0,09 y la esperada (He) de 0,42, indicando un alto nivel de endogamia (Fis = 0,60). Se infirieron las relaciones genéticas por medio de un análisis de similitud (DICE) y un análisis bayesiano (STRUCTURE) detectando 2 agrupaciones para los genotipos de arveja analizados, con una alta similitud con las características agromorfológicas de cada genotipo. Los resultados del presente estudio serán útiles para la creación de futuros programas de fitomejoramiento en arveja. |
| Databáze: | OpenAIRE |
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