Detección serológica y molecular del Potato virus X (PVX) en tubérculos-semilla de papa (Solanum tuberosum L. y Solanum phureja Juz. & Bukasov) en Antioquia, Colombia
| Autor: | Manuel Andrés Olarte Quintero, Mauricio Marín Montoya, Daniela García Ruíz, Pablo Andrés Gutiérrez Sánchez |
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| Jazyk: | Spanish; Castilian |
| Rok vydání: | 2016 |
| Předmět: |
0106 biological sciences
0301 basic medicine biology lcsh:Biotechnology Mean value RT-PCR Diagnostic test Pomovirus General Medicine Potato virus X biology.organism_classification Solanum tuberosum 01 natural sciences Virus 03 medical and health sciences Horticulture 030104 developmental biology lcsh:TP248.13-248.65 Solanum phureja DAS-ELISA 010606 plant biology & botany |
| Zdroj: | Revista Colombiana de Biotecnología, Vol 18, Iss 1, Pp 104-111 (2016) |
| ISSN: | 1909-8758 0123-3475 |
| Popis: | El Potato virus (PVX) es uno de los virus más limitantes del cultivo de la papa en el mundo. Es transmitido solamente por contacto y por tubérculo-semilla. Su control se fundamenta en la siembra de tubérculos certificados por su sanidad viral y en la disponibilidad de metodologías de diagnóstico altamente sensibles. En este trabajo se evaluó la prevalencia del PVX en cuatro diferentes tejidos de tubérculos de Solanum tuberosum subsp. andigena var. Diacol-Capiro y S. phureja var. Criolla Colombia utilizando pruebas de DAS-ELISA para 128 submuestras y de RT-qPCR para 32 grupos de submuestras (4 submuestras/grupo). Los resultados de las pruebas serológicas indicaron la presencia de PVX en el 6,25 y 50% de las submuestras analizadas para la variedad Diacol-Capiro y Criolla Colombia, respectivamente; mientras que los niveles de prevalencia del PVX utilizando la detección por RT-qPCR fueron del 93,75%, independientemente de la variedad de papa y del tejido evaluado. Los valores promedio del ciclo umbral (Ct) en las RT-qPCR fueron de 25,6 (Ct=18,02 a 34,49) y el análisis de las curvas de desnaturalización permitió identificar dos variantes del virus con valores de Tm de 79,5±1°C y 83,7±1°C. La secuenciación de los amplicones obtenidos por RT-qPCR para los controles positivos y para dos de las muestras, confirmó su naturaleza viral. Estos resultados señalan unos muy altos niveles de prevalencia de PVX en el material de siembra de papa en Antioquia y la necesidad de fortalecer los programas de certificación de semilla con pruebas de detección como RT-qPCR. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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