Implications of using an average relationship matrix in genetic evaluation for a population using multiple-sire matings

Autor: D. J. Johnston, R. J. Kerr, H. U. Graser, Brian Kinghorn
Rok vydání: 2011
Předmět:
Zdroj: Journal of animal breeding and genetics = Zeitschrift fur Tierzuchtung und Zuchtungsbiologie. 111(1-6)
ISSN: 0931-2668
Popis: Summary Ambiguous paternity can be incorporated into the mixed model equations (MME) by including the average numerator relatinship matrix (average A), which averages the true sire-offspring relationship over the putative sires. A previous study has shown that some overestimation of genetic trend results from this substitution. A population of 40 breeding females and 2 breeding males was simulated 1,000 times with either random mating or sequential selection continuing for 8 breeding cycles. In the selection case candidates were ranked on estimated breeding values (EBVs) calculated from the MME with an animal model and the average A. Variances of the EBVs and prediction errors were computed. The results showed the average A incorrectly perceives both the variance of family sizes among males and the variance loss due to selection to be smaller. This will lead to an overestimation of genetic trend. Zusammenfassung Folgerungen aus der Anwendung einer durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix bei der Zuchtwertschatzung fur eine Population mit mehreren Vatern in einer Paarungsgruppe In den Mischmodellgleichungen kann eine unklare vaterliche Abstammung durch die Verwendung einer durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix, die die Abstammung zu gleichen Teilen uber die moglichen Vater aufteilt, berucksichtigt werden. Eine fruhere Arbeit hat gezeigt, das diese Masnahme zu einer gewissen Uberschatzung des genetischen Fortschritts fuhrt. Eine Population mit 40 weiblichen und 2 mannlichen Tieren wurde 1000mal uber 8 Paarungsperioden simuliert und zwar mit und ohne gerichteter Selektion. Im Falle der Selektion wurden die Tiere aufgrund der mit einem Tiermodell und der durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix geschatzten Zuchtwerte geordnet. Die Varianzen der Zuchtwerte und der Schatzfehler wurden berechnet. Die Ergebnisse zeigen, das durch eine durch-schnittliche Verwandtschaftsmatrix die Varianz der Grose der Nachkommensgruppen der Vater und der Verlust an genetischer Varianz aufgrund der Selektion unterschatzt wird. Dies fuhrt zu einer Uberschatzung des genetischen Fortschritts.
Databáze: OpenAIRE