Morphological Analysis and Feature Extraction of Neurons from Mouse Cortices Multiscale 3D Microscopic Images
| Autor: | Eric Debreuve, Kawssar Harb, Alexis Zubiolo, Xavier Descombes, Michèle Studer |
|---|---|
| Přispěvatelé: | Morphologie et Images (MORPHEME), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut de Biologie Valrose (IBV), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Signal, Images et Systèmes (Laboratoire I3S - SIS), Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Valrose (IBV), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe IMAGES-CREATIVE, Signal, Images et Systèmes (Laboratoire I3S - SIS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), Zubiolo, Alexis, Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) |
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2015 |
| Předmět: |
Matching (graph theory)
Computer science Feature extraction 02 engineering and technology Mice 03 medical and health sciences Imaging Three-Dimensional [INFO.INFO-CV] Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV] 0302 clinical medicine [STAT.ML]Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML] Cortex (anatomy) 0202 electrical engineering electronic engineering information engineering medicine Animals Computer vision Cerebral Cortex Neurons business.industry [INFO.INFO-CV]Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV] [MATH.MATH-OC] Mathematics [math]/Optimization and Control [math.OC] 020206 networking & telecommunications Pattern recognition Programming Linear [STAT.ML] Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML] medicine.anatomical_structure [INFO.INFO-TI] Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] [INFO.INFO-TI]Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] Morphological analysis Artificial intelligence [MATH.MATH-OC]Mathematics [math]/Optimization and Control [math.OC] business Algorithms 030217 neurology & neurosurgery |
| Zdroj: | Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2015 Aug;2015:7466-9 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2015) 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2015), IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS), Aug 2015, Milan, Italy. ⟨10.1109/EMBC.2015.7320118⟩ EMBC |
| DOI: | 10.1109/EMBC.2015.7320118⟩ |
| Popis: | International audience; In this paper, we propose a framework to analyze the morphology of mouse neurons in the layer V of the cortex from 3D microscopic images. We are given 8 sets of images, each of which is composed of a 10x image showing the whole neurons, and a few (2 to 5) 40x images focusing on the somas. The framework consists in segmenting the neurons on both types of images to compute a set of specific morphological features, and in matching the neurons in the 40x images to their counterparts in the 10x images to combine the features we obtained, in a fully automatic fashion. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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