Performance and cost efficiency of KRAS mutation testing for metastatic colorectal cancer in routine diagnosis: the MOKAECM study, a nationwide experience

Autor: Pierre Laurent-Puig, Jean-François Emile, Marie-Claude Gorisse, Pascaline Aucouturier, Jean-Philippe Merlio, Florence de Fraipont, Jean-Louis Merlin, Isabelle Durand-Zaleski, Frédérique Nowak, Karen Leroy, Thierry Frebourg, Alain Morel, Hélène Blons, Delphine Le Corre, Gilles Chatellier, Jean-François Côté, Jean-Christophe Sabourin, L'Houcine Ouafik, Etienne Rouleau, Jean-Christophe Boyer, Nathanaël Charrier, Jean-Christophe Pages, Gérard Milano, Patricia de Cremoux
Přispěvatelé: Bases moléculaires de la réponse aux xénobiotiques (U775 (IFR95)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin, Service de Santé Publique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Centre d'Investigation Clinique - Epidemiologie Clinique/essais Cliniques [CHU HEGP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM), Université de Montréal (UdeM), Virus, pseudo-virus: Morphogénèse et Antigénicité, Université de Tours (UT)-EA3856, Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Biochimie [CHRU Nîmes], Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), CHU Bordeaux [Bordeaux], Oppelia, Institut Jean Godinot [Reims], UNICANCER, Hôpital Saint Louis, Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département de pathologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Département de pharmacogénomique, Centre de Lutte contre le Cancer Antoine Lacassagne [Nice] (UNICANCER/CAL), UNICANCER-Université Côte d'Azur (UCA)-UNICANCER-Université Côte d'Azur (UCA), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie (CRO2), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Alexis Vautrin (CAV), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut national du cancer [Boulogne] (INCA), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biomarqueurs et essais cliniques en Cancérologie et Onco-Hématologie (BECCOH), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay, Service d'anatomie pathologique [CHU Ambroise-Paré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Département de la recherche clinique et du développement, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique (MEPPOT - U1147), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Tours-EA3856, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherches Cliniques de Montréal, Université de Montréal, Université de Montréal [Montréal], Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jean Godinot, CRLCC Jean Godinot, CHU Saint Louis [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CRLCC Antoine Lacassagne, Laboratoire épidémiologie et oncogénèse des tumeurs digestives, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Service d'anatomie pathologique, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Ambroise Paré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), Bases moléculaires de la réponse aux xénobiotiques ( U775 (IFR95) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Centre d'Investigation Clinique - Epidemiologie Clinique/essais Cliniques de l'Hopital Europeen Georges Pompidou, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Montréal, CHRU Tours, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes ( BPMP ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie ( CRO2 ), Aix Marseille Université ( AMU ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche en Automatique de Nancy ( CRAN ), Université de Lorraine ( UL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Alexis Vautrin ( CAV ), Institut national du cancer [Boulogne] ( INCA ), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Unité de Recherche Clinique en Economie de la santé d'Ile de France (URC Eco), Médecine Personnalisée, Pharmacogénomique, Optimisation Thérapeutique ( MEPPOT - U1147 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Merlin, Jean-Louis
Rok vydání: 2013
Předmět:
Oncology
Colorectal cancer
Epidemiology
Molecular oncology
MESH: Antibodies
Monoclonal
0302 clinical medicine
MESH : Fixatives
MESH: Fixatives
Neoplasm Metastasis
lcsh:Science
MESH: Tissue Embedding
0303 health sciences
MESH: Genetic Testing
Antibodies
Monoclonal
3. Good health
MESH: Reproducibility of Results
ErbB Receptors
[ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN]
030220 oncology & carcinogenesis
MESH : Neoplasm Metastasis
MESH : Proto-Oncogene Proteins
[SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN]
Medicine
MESH : Colorectal Neoplasms
MESH : Sensitivity and Specificity
MESH: ras Proteins
medicine.medical_specialty
MESH: Receptor
Epidermal Growth Factor
Gastroenterology and Hepatology
Sensitivity and Specificity
Proto-Oncogene Proteins p21(ras)
03 medical and health sciences
Fixatives
MESH : Genetic Testing
[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry
Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN]
External quality assessment
Gastrointestinal Tumors
Cancer Detection and Diagnosis
Humans
Genetic Testing
Genotyping
Biology
MESH: Humans
Tissue Embedding
MESH : Reproducibility of Results
MESH : Humans
lcsh:R
medicine.disease
MESH: Neoplasm Metastasis
MESH: Sensitivity and Specificity
MESH : Biopsy
ras Proteins
lcsh:Q
MESH : Sequence Analysis
DNA
MESH: Sequence Analysis
DNA
Biopsy
Cancer Treatment
lcsh:Medicine
Bioinformatics
medicine.disease_cause
MESH : Tissue Embedding
MESH: Biopsy
MESH : Receptor
Epidermal Growth Factor
Gastrointestinal Cancers
Sanger sequencing
Multidisciplinary
Drug development
MESH : Antibodies
Monoclonal
symbols
KRAS
France
Colorectal Neoplasms
Research Article
MESH: Cell Line
Tumor
Clinical Research Design
Rectal Cancer
symbols.namesake
Antibody Therapy
Diagnostic Medicine
Molecular genetics
Internal medicine
Cell Line
Tumor
Proto-Oncogene Proteins
medicine
MESH : France
030304 developmental biology
Population Biology
MESH : Cell Line
Tumor
business.industry
Reproducibility of Results
Cancers and Neoplasms
Sequence Analysis
DNA
MESH: France
MESH: Proto-Oncogene Proteins
Gastric Cancer
MESH : ras Proteins
business
MESH: Colorectal Neoplasms
Zdroj: PLoS ONE
PLoS ONE, Vol 8, Iss 7, p e68945 (2013)
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (7), pp.e68945. ⟨10.1371/journal.pone.0068945⟩
PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e68945. ⟨10.1371/journal.pone.0068945⟩
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (7), pp.e68945. 〈10.1371/journal.pone.0068945〉
ISSN: 1932-6203
Popis: International audience; PURPOSE: Rapid advances in the understanding of cancer biology have transformed drug development thus leading to the approval of targeted therapies and to the development of molecular tests to select patients that will respond to treatments. KRAS status has emerged as a negative predictor of clinical benefit from anti-EGFR antibodies in colorectal cancer, and anti-EGFR antibodies use was limited to KRAS wild type tumors. In order to ensure wide access to tumor molecular profiling, the French National Cancer Institute (INCa) has set up a national network of 28 regional molecular genetics centers. Concurrently, a nationwide external quality assessment for KRAS testing (MOKAECM) was granted to analyze reproducibility and costs. METHODS: 96 cell-line DNAs and 24 DNA samples from paraffin embedded tumor tissues were sent to 40 French laboratories. A total of 5448 KRAS results were collected and analyzed and a micro-costing study was performed on sites for 5 common methods by an independent team of health economists. RESULTS: This work provided a baseline picture of the accuracy and reliability of KRAS analysis in routine testing conditions at a nationwide level. Inter-laboratory Kappa values were >0.8 for KRAS results despite differences detection methods and the use of in-house technologies. Specificity was excellent with only one false positive in 1128 FFPE data, and sensitivity was higher for targeted techniques as compared to Sanger sequencing based methods that were dependent upon local expertise. Estimated reagent costs per patient ranged from €5.5 to €19.0. CONCLUSION: The INCa has set-up a network of public laboratories dedicated to molecular oncology tests. Our results showed almost perfect agreements in KRAS testing at a nationwide level despite different testing methods ensuring a cost-effective equal access to personalized colorectal cancer treatment.
Databáze: OpenAIRE
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