Genetic variability of Brazilian rice landraces determined by SSR markers
| Autor: | Clistiane dos Anjos Mendes, Rosana Pereira Vianello Brondani, Elcio Perpetuo Guimaraes, Jaime Roberto Fonseca, Tuliana O. Brunes, Claudio Brondani, Tereza Cristina de Oliveira Borba |
|---|---|
| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2009 |
| Předmět: |
Oryza sativa
business.industry food and beverages melhoramento participativo Biology microssatélites microsatellites melhoramento de arroz Biotechnology participatory breeding rice breeding Agronomy genotyping Genetic marker genotipagem Genetic variation Genotype Microsatellite Animal Science and Zoology Cultivar Genetic variability business Agronomy and Crop Science Selection (genetic algorithm) |
| Zdroj: | Pesquisa Agropecuária Brasileira, Volume: 44, Issue: 7, Pages: 706-712, Published: JUL 2009 Pesquisa Agropecuária Brasileira v.44 n.7 2009 Pesquisa Agropecuária Brasileira Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
| Popis: | The objective of this study was to evaluate the genetic variability of rice (Oryza sativa) landraces collected in Brazilian small farms. Twelve simple sequence repeat (SSR) markers characterized 417 landraces collected in 1986, 1987 and 2003, in the state of Goiás, Brazil. The number of landraces with long and thin grain type increased in the evaluated period, probably due to market demand. Based on the molecular data, the genetic variability increased during this period and, as per to the factorial correspondence analysis, most of the accessions were grouped according to the year of collection. The incorporation of modern rice cultivars in landrace cultivation areas and the selection carried out by small farmers are the most probable factors responsible for increasing landrace genetic variability, during the evaluated period. Genotype exchange between farmers, selection practice and local environmental adaptation are able to generate novel adapted allele combinations, which can be used by breeding programs, to reinitiate the process. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de variedades locais de arroz (Oryza sativa), coletadas em pequenas propriedades rurais. Doze marcadores microssatélites (SSR) caracterizaram 417 variedades locais, coletadas em 1986, 1987 e 2003, no Estado de Goiás. O número de variedades locais com tipo de grão longo e fino aumentou no intervalo de tempo avaliado, provavelmente em razão da demanda de mercado. Conforme os dados moleculares, houve aumento na variabilidade genética e, por meio da análise fatorial de correspondência, observou-se que a maior parte dos acessos foi agrupada de acordo com o ano de coleta. A incorporação de cultivares modernas de arroz às áreas de cultivo das variedades locais e a seleção realizada pelos pequenos agricultores são, provavelmente, os fatores responsáveis pelo aumento observado na variabilidade genética, ao longo do período avaliado. O intercâmbio de genótipos entre fazendeiros, a prática da seleção e a adaptação ambiental ao local de cultivo são capazes de gerar novas combinações alélicas adaptadas que, por sua vez, podem ser usadas pelos programas de melhoramento, para reiniciar o processo. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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