Development of an ELA-DRA gene typing method based on pyrosequencing technology
| Autor: | Silvina Díaz, María Gabriela Echeverría, Jose Luis Vega-Pla, Diego Manuel Posik, Veronica It, Guillermo Giovambattista, N. L. Pena, Pilar Peral-García, A. Rogberg-Muñoz |
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| Jazyk: | angličtina |
| Rok vydání: | 2008 |
| Předmět: |
Genetics
Immunology Histocompatibility Antigens Class II PYROSEQUENCING Exons Sequence Analysis DNA General Medicine Biology Biochemistry DRA POLYMORPHISM MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX EQUINE Gene Frequency CIENCIAS AGRÍCOLAS Animals Immunology and Allergy Pyrosequencing Horses Typing Otras Ciencias Agrícolas Alleles Polymorphism Single-Stranded Conformational |
| DOI: | 10.1111/j.1399-0039.2008.01113.x |
| Popis: | The polymorphism of equine lymphocyte antigen (ELA) class II DRA gene had been detected by polymerase chain reaction-single-strand conformational polymorphism (PCR-SSCP) and reference strand-mediated conformation analysis. These methodologies allowed to identify 11 ELA-DRA exon 2 sequences, three of which are widely distributed among domestic horse breeds. Herein, we describe the development of a pyrosequencing-based method applicable to ELA-DRA typing, by screening samples from eight different horse breeds previously typed by PCR-SSCP. This sequence-based method would be useful in high-throughput genotyping of major histocompatibility complex genes in horses and other animal species, making this system interesting as a rapid screening method for animal genotyping of immune-related genes. Fil: Diaz, Silvina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Echeverria, Maria Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina Fil: It, Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Posik, Diego Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Rogberg Muñoz, Andres. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Pena, N. L.. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Peral Garcia, Pilar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina Fil: Vega Pla, J. L.. Laboratorio de Investigación Aplicada. Servicio de Cría Caballar y Remonta; España Fil: Giovambattista, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Centro de Investigaciones en Genética Básica y Aplicada; Argentina |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
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