Identification of 28 novel mutations in the Bardet-Biedl syndrome genes: the burden of private mutations in an extensively heterogeneous disease

Autor: Serge Vicaire, Dominique Bonneau, Pierre Bitoun, Nicholas Katsanis, Sophie Hellé, Alice Goldenberg, Valérie Drouin-Garraud, Marie-Claire Vincent, Jean Marc Danse, Vincent Marion, Sabine Sigaudy, Joelle Roume, M. Hamdani, Sylvie Odent, Christine Francannet, Erica E. Davis, Alain Verloes, V. Bennouna-Greene, Jean Muller, Josseline Kaplan, Hélène Dollfus, Virginie Laurier, Jean-Louis Mandel, André Mégarbané, Carmen C. Leitch, Jane Green, Mireille Cossée, Corinne Stoetzel, Nicole Philip, Olivier Poch
Přispěvatelé: Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire de diagnostic génétique, CHU Strasbourg, Laboratoire de Génétique Médicale (LGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns Hopkins University (JHU), Unité de Génétique Médicale, Université Saint-Joseph de Beyrouth (USJ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hôpital 20 Août 1953, Service de Génétique et de Diagnostic Prénatal, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Service de génétique médicale, CHI Poissy-Saint-Germain, Service de Pédiatrie [Jean Verdier], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Service de Génétique Clinique, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-hôpital Sud, Department of Genetics, Memorial University of Newfoundland [St. John's], Center for Human Disease Modeling, Duke University [Durham], Service de génétique [Angers], Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Unité fonctionnelle de génétique clinique, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Robert Debré-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chaire Génétique Humaine, Collège de France (CdF (institution)), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Memorial University of Newfoundland = Université Memorial de Terre-Neuve [St. John's, Canada] (MUN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Collège de France - Chaire Génétique Humaine, De Villemeur, Hervé, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire ( IGBMC ), Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Génétique Médicale, Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg]-AVENIR-Inserm, Johns Hopkins University ( JHU ), Université Saint-Joseph de Beyrouth ( USJ ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier, Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Sud, Duke university [Durham], Université d'Angers ( UA ) -CHU Angers, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire ( IGBMC ), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2010
Předmět:
BBS2
Adult
Male
congenital
hereditary
and neonatal diseases and abnormalities
BBS1
Molecular Sequence Data
[SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics
Biology
medicine.disease_cause
Polymorphism
Single Nucleotide
Article
03 medical and health sciences
Gene Frequency
Gene Duplication
[SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Gene duplication
Genetics
medicine
Missense mutation
Humans
[ SDV.BDD ] Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Genetic Testing
Bardet-Biedl Syndrome
[SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Genetics (clinical)
Chromatography
High Pressure Liquid
Polymorphism
Single-Stranded Conformational
030304 developmental biology
Aged
0303 health sciences
Mutation
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics
Genetic heterogeneity
030305 genetics & heredity
Decision Trees
Homozygote
Chromosome Mapping
Sequence Analysis
DNA
Middle Aged
Disease gene identification
3. Good health
Pedigree
BBS12
Female
[ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics
Gene Deletion
Microsatellite Repeats
Zdroj: Human Genetics
Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩
Human Genetics, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩
Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. 〈10.1007/s00439-010-0804-9〉
ISSN: 0340-6717
1432-1203
DOI: 10.1007/s00439-010-0804-9⟩
Popis: International audience; Bardet-Biedl syndrome (BBS), an emblematic disease in the rapidly evolving field of ciliopathies, is characterized by pleiotropic clinical features and extensive genetic heterogeneity. To date, 14 BBS genes have been identified, 3 of which have been found mutated only in a single BBS family each (BBS11/TRIM32, BBS13/MKS1 and BBS14/MKS4/NPHP6). Previous reports of systematic mutation detection in large cohorts of BBS families (n > 90) have dealt only with a single gene, or at most small subsets of the known BBS genes. Here we report extensive analysis of a cohort of 174 BBS families for 12/14 genes, leading to the identification of 28 novel mutations. Two pathogenic mutations in a single gene have been found in 117 families, and a single heterozygous mutation in 17 families (of which 8 involve the BBS1 recurrent mutation, M390R). We confirm that BBS1 and BBS10 are the most frequently mutated genes, followed by BBS12. No mutations have been found in BBS11/TRIM32, the identification of which as a BBS gene only relies on a single missense mutation in a single consanguineous family. While a third variant allele has been observed in a few families, they are in most cases missenses of uncertain pathogenicity, contrasting with the type of mutations observed as two alleles in a single gene. We discuss the various strategies for diagnostic mutation detection, including homozygosity mapping and targeted arrays for the detection of previously reported mutations.
Databáze: OpenAIRE
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