Изучение метилирования сайтов RCGY в регуляторной области гена FAM19A4 в препаратах ДНК клеточных линий человека методом GLAD-ПЦР анализа

Jazyk: ruština
Rok vydání: 2021
Předmět:
DOI: 10.26213/se.2021.97.62.001
Popis: Методом GLAD-ПЦР анализа определяли метилирования сайтов RCGY в регуляторной области гена FAM19A4 (Хр3: 68932451 — 68932800) в препаратах ДНК малигнантных клеточных линий человека Raji, Jurkat, HeLa, U-937 и контрольной ДНК клеточной линии фибробластов легких L68. Показано, что октануклеотид GCGCGCGC (Хр3: 68932500), находящийся в первом экзоне гена FAM19A4, расщепляется приблизительно в равной степени в ДНК всех 4-х малигнантных клеточных линий человека, тогда как в ДНК L68 этом сайт гидролизуется в 10-15 раз слабее. Эти результаты соответствуют полученным ранее данным эпигеномного секвенирования ДНК L68, Raji и U-937. Метилирование CG-динуклеотидов в позициях 68932727 и/или 68932740 в районе промотора гена FAM19A4 происходит только в опухолевых ДНК и не наблюдается в ДНК L68, а метилирование CG-динуклеотида в позиции 68932704 наблюдается только в ДНК HeLa.
The method of GLAD-PCR analysis was used to determine the methylation of RCGY sites in the regulatory region of the FAM19A4 gene (Xp3: 68932451 – 68932800) in the DNA preparations of the malignant human cell lines Raji, Jurkat, HeLa, U-937 and the control DNA of the lung fibroblast cell line L68. It is shown that the octanucleotide GCGCGCGC (Xp3: 68932500), located in the first exon of the FAM19A4 gene, is cleaved approximately equally in the DNA of all 4 malignant human cell lines, whereas in the DNA of L68 this site is hydrolyzed 10-15 times weaker. These results are consistent with data of epigenomic sequencing of L68, Raji, and U-937 DNA. Methylation of CG-dinucleotides at positions 68932727 and/or 68932740 in the promoter of the FAM19A4 gene occurs only in tumor DNA and is not observed in L68 DNA, whereas methylation of CG-dinucleotide at position 68932704 is observed only in HeLa DNA.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: