Identificación de polimorfismos en el gen RXAM1 de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascular
Autor: | Andrea del Pilar Barrera, Camilo Ernesto López Carrascal, Johana Carolina Soto-Sedano |
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Rok vydání: | 2020 |
Předmět: |
0106 biological sciences
0301 basic medicine Genetics Bacterial disease Strain (biology) Single-nucleotide polymorphism Quantitative trait locus Biology 01 natural sciences Phenotype Crop 03 medical and health sciences 030104 developmental biology Allele General Agricultural and Biological Sciences Gene 010606 plant biology & botany |
Zdroj: | Acta Biológica Colombiana. 25:185-193 |
ISSN: | 1900-1649 0120-548X |
DOI: | 10.15446/abc.v25n2.77564 |
Popis: | La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se logró identificar un gen de resistencia denominado RXAM1, el cual codifica para una proteína que posee un dominio LRR (Leucine-Rich Repeat) extracelular y un dominio STK (Serine Threonine Kinase) citoplasmático. RXAM1 colocaliza con un QTL que explica el 13 % de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam. En este trabajo se evaluó la respuesta a la infección con la cepa XamCIO136 en diez diferentes variedades de yuca lo cual permitió identificar que las variedades TMS60444, SG10735, MCOL1522, MCOL1505 y MCOL2215 fueron susceptibles, mientras que CM6438-14, CM523-7 y MBRA902 se comportaron como resistentes. Así mismo se identificaron polimorfismos tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) en el gen RXAM1 en el mismo grupo de variedades. Las variedades SG10735, CM6438-14, TMS6044 y MBRA685 presentaron el mayor nivel de polimorfismos, mientras que las variedades CM523-7, CM2177-2 y MCOL1522 fueron menos polimórficas para este gen. Los análisis estadísticos no permitieron identificar una asociación significativa entre el fenotipo y los polimorfismos identificados. Este estudio representa un primer esfuerzo con miras a asociar variantes alélicas con el fenotipo de respuesta a la bacteriosis vascular. |
Databáze: | OpenAIRE |
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