Intraspecific variation in the first internal transcribed spacer (ITS1) of the nuclear ribosomal DNA inMelipona subnitida(Hymenoptera, Apidae), an endemic stingless bee from northeastern Brazil
| Autor: | Carlos Eduardo Alves Soares, Júlio Otávio Portela Pereira, Davi Coe Torres, Breno Magalhães Freitas, Darci de Oliveira Cruz, Thalles B. Grangeiro, Daniel Macedo de Melo Jorge |
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| Rok vydání: | 2006 |
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| Zdroj: | Apidologie. 37:376-386 |
| ISSN: | 1297-9678 0044-8435 |
| DOI: | 10.1051/apido:2006003 |
| Popis: | Melipona subnitida Ducke est une abeille sans aiguillon endemique du nord-est du Bresil. Malgre son importance economique dans la production locale de miel, la variabilite genetique de cette abeille n'a pas encore ete etudiee. Dans ce but nous avons sequence une partie du premier espaceur transcrit interne (ITS1) de l'ADN ribosomal. Pour estimer la variabilite intraspecifique nous avons preleve des echantillons d'abeilles dans diverses localites du nord-est du Bresil (Tab. 1 et Fig. 1). L'electrophorese sur gel d'agarose a permis d'evaluer les tailles de l'ITS1 et l'ITS2 a 1465 et 2240 paires de bases respectivement (Fig. 2). Les sequences partielles de l'ITS (environ 600 nucleotides) des echantillons de ces localites ont ete deposees dans la GenBank (numeros d'acces DQ078726-DQ078738). La repetition de sequences courtes et simples de un, deux, trois et quatre nucleotides ont ete trouvees dans toutes les abeilles echantillonnees. Nous avons aussi identifie deux locus importants de microsatellites avec des nombres de copies de 3 repetitions ou plus, (GGA) 3 et (AC) 8 mais ils n'ont presente aucune variabilite intraspecifique. La divergence moyenne des nucleotides (non compris les sites d'insertions/ deletions dans les alignements) entre les sequences partielles d'ITS 1 etait comprise entre 0 et 13 %, avec une valeur moyenne de 5 %. Mais lorsqu'on a pris en compte les sites d'insertions/deletions, chaque sequence etait unique avec une divergence des nucleotides entre 1,1 et 18 % (Tab. II). La variation intraspecifique de l'ITSl de M. subnitida est donc plus grande que les valeurs publiees jusqu'a ce jour pour d'autres organismes. Nous n'avons trouve en outre aucune correlation entre la divergence des sequences et la distance geographique des echantillons (Fig. 3). Nous considerons la forte variabilite intraspecifique de l'ITSl de M. subnitida comme la preuve que des populations isolees ont evolue individuellement sur une longue periode. Notre etude montre le fort potentiel de la region de l'ITS 1 comme outil moleculaire pour etudier la genetique des populations et la phylogeographie des especes. Ces informations sont importantes pour mettre au point des strategies appropriees de conservation. |
| Databáze: | OpenAIRE |
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