Characterization of satellite DNAs of the flour beetle Tribolium freemani Hinton

Autor: Veseljak, Damira
Přispěvatelé: Mravinac, Brankica, Besendorfer, Višnja
Jazyk: chorvatština
Rok vydání: 2019
Předmět:
Popis: Satelitne DNA su uzastopno ponavljajuće sekvence DNA dominantno smještene u heterokromatinskim regijama eukariotskih genoma. Iako često zaprimaju značajan udio u genomima, funkcija im još uvijek nije u potpunosti razjašnjena. Kukac brašnar Tribolium freemani, učestali štetnik u skladištima hrane, zanimljiv je za laboratorijska istraživanja zbog bliske srodnosti s modelnim organizmom Tribolium castaneum. Prije četvrt stoljeća u genomu vrste T. freemani opisana je satelitna DNA koja čini gotovo trećinu genomske sekvence. U ovom radu genom vrste T. freemani sekvenciran je tehnologijom sekvenciranja nove generacije (NGS) sa svrhom pronalaženja dosad neotkrivenih satelitnih DNA. Upotrebom bioinformatičkog alata TAREAN koji identificira potencijalne satelitne sekvence na temelju neposloženih NGS očitanja otkriveno je šest novih, niskozastupljenih satelitnih DNA čiji kumulativni udio u genomu iznosi
Databáze: OpenAIRE