Investigation of the impact of AXL, TLR3, and STAT2 in congenital Zika syndrome through genetic polymorphisms and protein-protein interaction network analyses.

Autor: Gomes JA; Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP), Porto Alegre, Brazil.; Laboratório de Medicina Genômica (LMG), Centro de Pesquisa Experimental (CPE), Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil., Sgarioni E; Laboratório de Medicina Genômica (LMG), Centro de Pesquisa Experimental (CPE), Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM), Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil., Boquett JA; Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e do Adolescente (PPGSCA), Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil.; Department of Neurology, University of California, San Francisco, California, USA., Kowalski TW; Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP), Porto Alegre, Brazil.; Laboratório de Medicina Genômica (LMG), Centro de Pesquisa Experimental (CPE), Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM), Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil.; Sistema Nacional de Informação sobre Agentes Teratogênicos (SIAT), Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil., Fraga LR; Laboratório de Medicina Genômica (LMG), Centro de Pesquisa Experimental (CPE), Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Sistema Nacional de Informação sobre Agentes Teratogênicos (SIAT), Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Medicina: Ciências Médicas (PPGCM), Porto Alegre, Brazil.; Departamento de Ciências Morfológicas, Instituto de Ciências Básicas da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil., Terças-Trettel ACP; Departamento de Enfermagem, Universidade do Estado de Mato Grosso (UNEMAT), Tangará da Serra, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva, Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Cuiabá, Brazil., da Silva JH; Secretaria Municipal de Saúde de Tangará da Serra, Tangará da Serra, Brazil., Ribeiro BFR; Fundação Hospital de Clínicas do Acre (FUNDACRE), Rio Branco, Brazil., Galera MF; Departamento de Pediatria, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Cuiabá, Brazil.; Hospital Universitário Júlio Müller (HUJM), Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Empresa Brasileira de Serviços Hospitalares (EBSERH), Cuiabá, Brazil., de Oliveira TM; Hospital Universitário Júlio Müller (HUJM), Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), Empresa Brasileira de Serviços Hospitalares (EBSERH), Cuiabá, Brazil., Carvalho de Andrade MDF; Universidade Estadual do Ceará (UECE), Fortaleza, Brazil.; Centro Universitário Christus (UNICHRISTUS), Fortaleza, Brazil.; Faculdade Paulo Picanço, Fortaleza, Brazil.; Hospital Geral Dr. César Cals, Fortaleza, Brazil., Carvalho IF; Centro Universitário Christus (UNICHRISTUS), Fortaleza, Brazil., Schüler-Faccini L; Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM), Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e do Adolescente (PPGSCA), Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil.; Sistema Nacional de Informação sobre Agentes Teratogênicos (SIAT), Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil., Vianna FSL; Instituto Nacional de Genética Médica Populacional (INAGEMP), Porto Alegre, Brazil.; Laboratório de Medicina Genômica (LMG), Centro de Pesquisa Experimental (CPE), Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPGBM), Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Brazil.; Sistema Nacional de Informação sobre Agentes Teratogênicos (SIAT), Serviço de Genética Médica, Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA), Porto Alegre, Brazil.; Programa de Pós-Graduação em Medicina: Ciências Médicas (PPGCM), Porto Alegre, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Birth defects research [Birth Defects Res] 2023 Oct 01; Vol. 115 (16), pp. 1500-1512. Date of Electronic Publication: 2023 Aug 01.
DOI: 10.1002/bdr2.2232
Abstrakt: Introduction: Zika virus (ZIKV) is a human teratogen that causes congenital Zika syndrome (CZS). AXL, TLR3, and STAT2 are proteins involved in the ZIKV's entry into cells (AXL) and host's immune response (TLR3 and STAT2). In this study, we evaluated the role of genetic polymorphisms in these three genes as risk factors to CZS, and highlighted which proteins that interact with them could be important for ZIKV infection and teratogenesis.
Materials and Methods: We evaluate eighty-eight children exposed to ZIKV during the pregnancy, 40 with CZS and 48 without congenital anomalies. The evaluated polymorphisms in AXL (rs1051008), TLR3 (rs3775291), and STAT2 (rs2066811) were genotyped using TaqMan® Genotyping Assays. A protein-protein interaction network was created in STRING database and analyzed in Cytoscape software.
Results: We did not find any statistical significant association among the polymorphisms and the occurrence of CZS. Through the analyses of the network composed by AXL, TLR3, STAT2 and their interactions targets, we found that EGFR and SRC could be important proteins for the ZIKV infection and its teratogenesis.
Conclusion: In summary, our results demonstrated that the evaluated polymorphisms do not seem to represent risk factors for CZS; however, EGFR and SRC appear to be important proteins that should be investigated in future studies.
(© 2023 Wiley Periodicals LLC.)
Databáze: MEDLINE
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