Detection of ATXN2 Expansions in an Exome Dataset: An Underdiagnosed Cause of Parkinsonism.

Autor: Casse F; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Courtin T; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France.; AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière, U.F. de Neurogénétique Moléculaire et Cellulaire Paris France., Tesson C; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Ferrien M; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Noël S; AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière, U.F. de Neurogénétique Moléculaire et Cellulaire Paris France., Fauret-Amsellem AL; AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière, U.F. de Neurogénétique Moléculaire et Cellulaire Paris France., Gareau T; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Guegan J; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Anheim M; Service de Neurologie Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France.; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale-U964/Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7104/Université de Strasbourg Illkirch-Graffenstaden France.; Université de Strasbourg, Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg Strasbourg France., Mariani LL; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France.; Département de Neurologie AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière Paris France., Le Forestier N; Département de Neurologie AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière Paris France., Tranchant C; Service de Neurologie Hôpitaux Universitaires de Strasbourg Strasbourg France.; Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale-U964/Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7104/Université de Strasbourg Illkirch-Graffenstaden France.; Université de Strasbourg, Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg Strasbourg France., Corvol JC; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France.; Département de Neurologie AP-HP, Hôpital de la Pitié Salpêtrière Paris France., Lesage S; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France., Brice A; Sorbonne Université, Institut du Cerveau - Paris Brain Institute - ICM, Institut National de la Recherche Médicale-U1127, Centre National de la Recherche Scientifique-UMR7225 Paris France.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Movement disorders clinical practice [Mov Disord Clin Pract] 2023 Mar 07; Vol. 10 (4), pp. 664-669. Date of Electronic Publication: 2023 Mar 07 (Print Publication: 2023).
DOI: 10.1002/mdc3.13699
Abstrakt: Background: CAG-repeat expansions in Ataxin 2 ( ATXN2 ) are known to cause spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2), but CAA interrupted expansions may also result in autosomal dominant Parkinson's disease (AD PD). However, because of technical limitations, such expansions are not explored in whole exome sequencing (WES) data.
Objectives: To identify ATXN2 expansions using WES data from PD cases.
Methods: We explored WES data from a cohort of 477 index cases with PD using ExpansionHunter (Illumina DRAGEN Bio-IT Platform, San Diego, CA). Putative expansions were confirmed by combining polymerase chain reaction and fragment length analysis followed by sub-cloning and sequencing methods.
Results: Using ExpansionHunter, we identified three patients from two families with AD PD carrying either ATXN2 22/39 or 22/37 repeats, both interrupted by four CAA repeats.
Conclusion: These findings demonstrate the usefulness of WES to detect pathogenic CAG repeat expansions, which were found in 1.7% of AD PD in the ATXN2 gene in our exome dataset.
(© 2023 The Authors. Movement Disorders Clinical Practice published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.)
Databáze: MEDLINE
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