The Genomic Profile Associated with Risk of Severe Forms of COVID-19 in Amazonian Native American Populations.

Autor: Pastana LF; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Silva TA; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Gellen LPA; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Vieira GM; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., de Assunção LA; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Leitão LPC; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., da Silva NM; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Coelho RCC; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., de Alcântara AL; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Vinagre LWMS; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Rodrigues JCG; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Borges Leal DFDV; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Fernandes MR; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., de Souza SJ; Instituto do Cérebro, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal 59076-550, Brazil.; BioME, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal 59078-400, Brazil.; Institute of Systems Genetics, West China Hospital, University of Sichuan, Chengdu 610041, China., Kroll JE; Instituto do Cérebro, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal 59076-550, Brazil., Ribeiro-Dos-Santos AM; Laboratório de Genética Humana e Médica, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, Brazil., Burbano RMR; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Guerreiro JF; Laboratório de Genética Humana e Médica, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, Brazil., de Assumpção PP; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Ribeiro-Dos-Santos ÂC; Laboratório de Genética Humana e Médica, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, Brazil., Dos Santos SEB; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil., Dos Santos NPC; Laboratório do Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-000, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Journal of personalized medicine [J Pers Med] 2022 Apr 01; Vol. 12 (4). Date of Electronic Publication: 2022 Apr 01.
DOI: 10.3390/jpm12040554
Abstrakt: Genetic factors associated with COVID-19 disease outcomes are poorly understood. This study aimed to associate genetic variants in the SLC6A20 , LZTFL1 , CCR9 , FYCO1 , CXCR6 , XCR1 , and ABO genes with the risk of severe forms of COVID-19 in Amazonian Native Americans, and to compare the frequencies with continental populations. The study population was composed of 64 Amerindians from the Amazon region of northern Brazil. The difference in frequencies between the populations was analyzed using Fisher's exact test, and the results were significant when p ≤ 0.05. We investigated 64 polymorphisms in 7 genes; we studied 47 genetic variants that were new or had impact predictions of high, moderate, or modifier. We identified 15 polymorphisms with moderate impact prediction in 4 genes ( ABO , CXCR6 , FYCO1 , and SLC6A20 ). Among the variants analyzed, 18 showed significant differences in allele frequency in the NAM population when compared to others. We reported two new genetic variants with modifier impact in the Amazonian population that could be studied to validate the possible associations with COVID-19 outcomes. The genomic profile of Amazonian Native Americans may be associated with protection from severe forms of COVID-19. This work provides genomic data that may help forthcoming studies to improve COVID-19 outcomes.
Databáze: MEDLINE