Insights into the full-length SRPK2 structure and its hydrodynamic behavior.

Autor: Barbosa ÉAA; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Seraphim TV; Instituto de Química de São Carlos, Universidade de São Paulo, São Carlos, SP, Brazil., Gandin CA; Departamento de Física e Biofísica, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brazil., Teixeira LF; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., da Silva RAG; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Righetto GL; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP, Brazil., Goncalves KA; Departamento de Genética, Evolução, Microbiologia e Imunologia, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP, Brazil., Vasconcellos RS; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Almeida MR; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Silva Júnior A; Departamento de Veterinária, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Fietto JLR; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil., Kobarg J; Instituto de Biologia, Departamento de Bioquímica e Biologia Tecidual e Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SP, Brazil., Gileadi C; Structural Genomics Consortium, Universidade Estadual de Campinas, Cidade Universitária Zeferino Vaz, Av. Dr. André Tosello, 550, Barão Geraldo, Campinas, SP, Brazil; Structural Genomics Consortium, University of Oxford, Old Road Campus Research Building, Roosevelt Drive, Oxford OX3 7DQ, UK., Massirer KB; Structural Genomics Consortium, Universidade Estadual de Campinas, Cidade Universitária Zeferino Vaz, Av. Dr. André Tosello, 550, Barão Geraldo, Campinas, SP, Brazil; Center for Molecular Biology and Genetic Engineering, CBMEG, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, SPUniversidade Estadual de Campinas, Campinas, Brazil., Borges JC; Instituto de Química de São Carlos, Universidade de São Paulo, São Carlos, SP, Brazil., de Oliveira Neto M; Departamento de Física e Biofísica, Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP, Brazil., Bressan GC; Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, Brazil. Electronic address: gustavo.bressan@ufv.br.
Jazyk: angličtina
Zdroj: International journal of biological macromolecules [Int J Biol Macromol] 2019 Sep 15; Vol. 137, pp. 205-214. Date of Electronic Publication: 2019 Jun 20.
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2019.06.135
Abstrakt: The serine/arginine-rich protein kinase 2 (SRPK2) has been reported as upregulated in several cancer types, with roles in hallmarks such as cell migration, growth, and apoptosis. These findings have indicated that SRPK2 is a promising emerging target in drug discovery initiatives. Although high-resolution models are available for SRPK2 (PDB 2X7G), they have been obtained with a heavily truncated recombinant protein version (~50% of the primary structure), due to the presence of long intrinsically unstructured regions. In the present work, we sought to characterize the structure of a full-length recombinant version of SRPK2 in solution. Low-resolution Small-Angle X-ray Scattering data were obtained for both versions of SRPK2. The truncated ΔNΔS-SRPK2 presented a propensity to dimerize at higher concentrations whereas the full-length SRPK2 was mainly found as dimers. The hydrodynamic behavior of the full-length SRPK2 was further investigated by analytical size exclusion chromatography and sedimentation velocity analytical ultracentrifugation experiments. SRPK2 behaved as a monomer-dimer equilibrium and both forms have an elongated shape in solution, pointing to a stretched-to-closed tendency among the conformational plasticity observed. Taken together, these findings allowed us to define unique structural features of the SRPK2 within SRPK family, characterized by its flexible regions outside the bipartite kinase domain.
(Copyright © 2019. Published by Elsevier B.V.)
Databáze: MEDLINE
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