Zobrazeno 1 - 10
of 47
pro vyhledávání: '"snATAC-seq"'
Autor:
E. Keats Shwab, Daniel C. Gingerich, Zhaohui Man, Julia Gamache, Melanie E. Garrett, Gregory E. Crawford, Allison E. Ashley-Koch, Geidy E. Serrano, Thomas G. Beach, Michael W. Lutz, Ornit Chiba-Falek
Publikováno v:
Acta Neuropathologica Communications, Vol 12, Iss 1, Pp 1-30 (2024)
Abstract The genetic architecture of Parkinson’s disease (PD) is complex and multiple brain cell subtypes are involved in the neuropathological progression of the disease. Here we aimed to advance our understanding of PD genetic complexity at a cel
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/c4ba46884caf45f480e2da17f07a08a6
Publikováno v:
Japanese Dental Science Review, Vol 59, Iss , Pp 412-420 (2023)
Single-cell omics and multi-omics have revolutionized our understanding of molecular and cellular biological processes at a single-cell level. In bone biology, the combination of single-cell RNA-sequencing analyses and in vivo lineage-tracing approac
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ae3f77331f7b4de9a348fac25350d6da
Autor:
Julia Gamache, Daniel Gingerich, E. Keats Shwab, Julio Barrera, Melanie E. Garrett, Cordelia Hume, Gregory E. Crawford, Allison E. Ashley-Koch, Ornit Chiba-Falek
Publikováno v:
Cell & Bioscience, Vol 13, Iss 1, Pp 1-33 (2023)
Abstract Background The genetic underpinnings of late-onset Alzheimer’s disease (LOAD) are yet to be fully elucidated. Although numerous LOAD-associated loci have been discovered, the causal variants and their target genes remain largely unknown. S
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/9ea1075676284e67b77747fb17402708
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Asa Thibodeau, Alper Eroglu, Christopher S. McGinnis, Nathan Lawlor, Djamel Nehar-Belaid, Romy Kursawe, Radu Marches, Daniel N. Conrad, George A. Kuchel, Zev J. Gartner, Jacques Banchereau, Michael L. Stitzel, A. Ercument Cicek, Duygu Ucar
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 22, Iss 1, Pp 1-19 (2021)
Abstract Detecting multiplets in single nucleus (sn)ATAC-seq data is challenging due to data sparsity and limited dynamic range. AMULET (ATAC-seq MULtiplet Estimation Tool) enumerates regions with greater than two uniquely aligned reads across the ge
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/16ab6a3786b04036bf43b168af964002
Autor:
Yeya Yu, Xiaoyu Wei, Qiuting Deng, Qing Lan, Yiping Guo, Lei Han, Yue Yuan, Peng Fan, Peiying Wu, Shuncheng Shangguan, Yang Liu, Yiwei Lai, Giacomo Volpe, Miguel A. Esteban, Chuanyu Liu, Yong Hou, Longqi Liu
Publikováno v:
Frontiers in Molecular Neuroscience, Vol 14 (2021)
Rats have been widely used as an experimental organism in psychological, pharmacological, and behavioral studies by modeling human diseases such as neurological disorders. It is critical to identify and characterize cell fate determinants and their r
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/fdbd0a872446443294bb9a581b325be0
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Gaspar-Maia, Leticia Sandoval, Wazim Mohammed Ismail, Amelia Mazzone, Mihai Dumbrava, Jenna Fernandez, Amik Munankarmy, Terra Lasho, Moritz Binder, Vernadette Simon, Kwan Hyun Kim, Nicholas Chia, Jeong-Heon Lee, S. John Weroha, Mrinal Patnaik, Alexandre
Publikováno v:
Genes; Volume 14; Issue 6; Pages: 1245
The snATAC + snRNA platform allows epigenomic profiling of open chromatin and gene expression with single-cell resolution. The most critical assay step is to isolate high-quality nuclei to proceed with droplet-base single nuclei isolation and barcodi