Zobrazeno 1 - 10
of 17
pro vyhledávání: '"sastavljanje genoma"'
Autor:
Čeple, Kristijan
Ovaj diplomski rad se bavi korištenjem FM-indeksa izgrađenog nad skupom kratkih očitanja u svrhu ispravljanja skupa dugih očitanja. Pomoću FM-indeksa implicitno se reprezentiraju svi de Bruijn grafovi za k-mer proizvoljne duljine. Pomoću 2 prol
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4131::28bb39a0528c1b689d5334c3ffaa8179
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:10818/datastream/PDF
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:10818/datastream/PDF
Autor:
Tešija, Toni
Genomi su sve češće korišteni podaci u proučavanju biologije i evolucije organizama, a broj dostupnih genoma u Banci gena se u posljednih nekoliko godina udvostručio kao posljedica razvoja tehnologije sekvenciranja. Razvoj ovih tehnologija utje
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______3999::e4f29310f8e2e98e718910f1110de896
https://repozitorij.agr.unizg.hr/islandora/object/agr:2529
https://repozitorij.agr.unizg.hr/islandora/object/agr:2529
Autor:
Požega, Luka
U ovom radu je opisan alat za računanje gornje granice u sastavljanju genoma. U potpunosti je napisan u jeziku C++ i testiran na nekoliko skupova podataka. Alat ispisuje postotak pokrivenosti genoma ovisno o ulaznim podacima dobivenih sekven-ciranje
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::e0acdf6c00211ac64923159c4cee10e4
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:6330
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:6330
Autor:
Vrček, Lovro
Cilj ovog rada bio je implementirati model temeljen na dubokom uˇcenju koji bi pove´cao toˇcnost sastavljenog genoma. Konstruirani model temelji se na arhitekturi rezidualne neuronske mreže te postiže toˇcnost ve´cu od trenutno najboljih alata
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::0092e6ad5700c5820e73331524ff0eda
https://www.bib.irb.hr/1010197
https://www.bib.irb.hr/1010197
Autor:
Wolf, Filip
Prilikom očitavanja i sekvenciranja gena, ne možemo odmah sekvencirati cijeli genom. U pravilu se dobije više manjih očitanja koje nazivamo kontizima. To su djelomično sastavljeni kraći dijelovi koje još treba spojiti u cijeli genom (niz kromo
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::bfb0a20fb85aa599b1f68c9ef9b6fda8
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:10195
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:10195
Autor:
Floreani, Filip
De-novo sastavljanje genoma proces je temeljen na preklapanju i analizi kratkih genetskih očitanja. Uslijed raznolikih tehničkih izazova, određene vrste lažnih očitanja i preklapanja mogu također biti sintetizirane, što uvelike otežava
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4131::176601a83efcec6ba5a13d7436775ff3
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:5827
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:5827
Autor:
Floreani, Filip
Proces sastavljanja genoma temeljen je na analizi preklapanja kratkih očitanja genetskog materijala. Zbog očitanja loše kvalitete, kao i zbog prisutnosti kimernih i ponavljajućih očitanja, osim ispravnih preklapanja pojavljuju se i lažna prekla
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::7edbcdd37e1513ef5ca5c4316a3bdb1a
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:2854
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:2854
Autor:
Jurić, Antonio
Razvijanje alata koji sastavljaju genom s dovoljnom točnošću da bi bili upotrebljivi u praksi još je otvoren problem. Uređaji treće generacije za sekvenciranje genoma omogućuju sastavljanje genoma s manjom stopom fragmentiranosti te visokom to
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4131::a24204f62bb8729a62ba57e37b4ff154
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:3110
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:3110
Autor:
Krpelnik, Ivan
U ovom radu implementiran je alat za produljivanje i povezivanje sastavljenih slijedova u programskom jeziku C++. Alat je nazvan Ezra i potencijalno bi se mogao koristiti za produljivanje i povezivanje u alatu za de novo sastavljanje Rala. Metode pro
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4131::dfb160b5dce3350e145a557957673ad2
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:3291/datastream/PDF
https://repozitorij.fer.unizg.hr/islandora/object/fer:3291/datastream/PDF
Autor:
Varga, Filip, Liber, Zlatko, Jakše, Jernej, Šatović, Zlatko, Radosavljević, Ivan, Grdiša, Martina
Mikrosatelitni biljezi su najčešće korišteni molekularni biljezi za analizu genetske raznolikosti i populacijske strukture biljnih vrsta. Standardna metoda za razvitak mikrosatelitnih biljega uključuje izradu genomne knjižnice obogaćene ponavl
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=57a035e5b1ae::e006dbe137333ee5cea0a5e225544185
https://www.bib.irb.hr/904997
https://www.bib.irb.hr/904997