Characterization of Plasma Cell-Free DNA Integrity Using Droplet-Based Digital PCR: Toward the Development of Circulating Tumor DNA-Dedicated Assays

Autor: Geoffroy Poulet, Fanny Garlan, Sonia Garrigou, Eleonora Zonta, Leonor Benhaim, Marie-Jennifer Carrillon, Audrey Didelot, Delphine Le Corre, Claire Mulot, Philippe Nizard, Frederic Ginot, Audrey Boutonnet-Rodat, Helene Blons, Jean-Baptiste Bachet, Julien Taïeb, Aziz Zaanan, Vanna Geromel, Laurence Pellegrina, Pierre Laurent-Puig, Shu-Fang Wang-Renault, Valerie Taly

Publikováno v: Frontiers in Oncology, Vol 11 (2021)

Background: Cellular-cell free-DNA (ccfDNA) is being explored as a diagnostic and prognostic tool for various diseases including cancer. Beyond the evaluation of the ccfDNA mutational status, its fragmentation has been investigated as a potential can

Externí odkaz: https://doaj.org/article/e638b9a1871d45d79e5c8adad9bc53a5

Multiplex picoliter-droplet digital PCR for quantitative assessment of EGFR mutations in circulating cell-free DNA derived from advanced non-small cell lung cancer patients

Autor: Meilin Zhang, Baisheng Pan, Wei Guo, Haiying Ji, Jiong Wu, Beili Wang, Fei Huang, Ying Zhao, Shenchao Wu, Chunyan Zhang, Qian Yu, Xin Zhang

Publikováno v: Molecular Medicine Reports

To explore the possible diagnostic value of liquid biopsy, two multiplex panels using picoliter-droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) were established to quantitatively assess the epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations in cell�

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::baa0d1cace8dcf832502771e3cf6845d
https://doi.org/10.3892/mmr.2017.6712

New methods to detect circulating tumor DNA : application to patients' follow-up

Autor: Garlan, Fanny

Publikováno v: Cancer. Université Sorbonne Paris Cité, 2016. Français. ⟨NNT : 2016USPCB108⟩

Circulating tumor DNA (ctDNA) carries tumor-specific alterations that are detectable by minimally invasive sampling. It represents a highly pertinent marker for cancer monitoring during patients’ follow-up. CtDNA detection requires a highly sensiti

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______1398::b157e59cea25d171d6a51d16ffd29c07
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02145652/file/va_Garlan_Fanny.pdf

Characterization of Plasma Cell-Free DNA Integrity Using Droplet-Based Digital PCR: Toward the Development of Circulating Tumor DNA-Dedicated Assays.

Autor: Poulet G; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Eurofins-Biomnis, Specialized Medical Biology Laboratory, Lyon, France., Garlan F; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Garrigou S; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Zonta E; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Benhaim L; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Department of Visceral and Surgical Oncology, Gustave Roussy, Villejuif, France., Carrillon MJ; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Didelot A; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Le Corre D; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Mulot C; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; CIC-EC4 URC, HEGP, Hôpitaux Universitaires Paris Ouest AP-HP, Paris, France., Nizard P; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Ginot F; Adelis, ID-solutions, Labège, France., Boutonnet-Rodat A; Adelis, ID-solutions, Labège, France., Blons H; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Department of Oncology, European Georges-Pompidou Hospital, AP-HP, Paris Descartes University, Paris, France., Bachet JB; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Sorbonne Universités, UPMC Université, Paris, France.; Department of Hepato-gastroenterology, Groupe Hospitalier Pitié Salpêtrière, Paris, France.; AGEO (Association des Gastroentérologues Oncologues), Paris, France., Taïeb J; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Department of Oncology, European Georges-Pompidou Hospital, AP-HP, Paris Descartes University, Paris, France.; AGEO (Association des Gastroentérologues Oncologues), Paris, France., Zaanan A; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Department of Oncology, European Georges-Pompidou Hospital, AP-HP, Paris Descartes University, Paris, France., Geromel V; Eurofins-Biomnis, Specialized Medical Biology Laboratory, Lyon, France., Pellegrina L; Eurofins-Biomnis, Specialized Medical Biology Laboratory, Lyon, France., Laurent-Puig P; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.; Department of Oncology, European Georges-Pompidou Hospital, AP-HP, Paris Descartes University, Paris, France., Wang-Renault SF; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France., Taly V; Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, CNRS, Sorbonne Université, USPC, Université de Paris, Equipe labellisée Ligue Nationale Contre le Cancer, CNRS SNC 5096, Paris, France.

Publikováno v: Frontiers in oncology [Front Oncol] 2021 May 06; Vol. 11, pp. 639675. Date of Electronic Publication: 2021 May 06 (Print Publication: 2021).