Zobrazeno 1 - 10
of 48
pro vyhledávání: '"milestoning"'
Publikováno v:
Molecules, Vol 29, Iss 20, p 4819 (2024)
Polymorphic transformation is important in chemical industries, in particular, in those involving explosive molecular crystals. However, due to simulating challenges in the rare event method and collective variables, understanding the transformation
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/e9b7916be15a44929e9fbe262d4702c8
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Yi-Chun Lin, Yun Lyna Luo
Publikováno v:
Frontiers in Molecular Biosciences, Vol 9 (2022)
Various all-atom molecular dynamics (MD) simulation methods have been developed to compute free energies and crossing rates of ions and small molecules through ion channels. However, a systemic comparison across different methods is scarce. Using a c
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/fec06e8a33d54f6294fe2e77c827e282
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Oliver Lemke, Bettina G. Keller
Publikováno v:
Algorithms, Vol 11, Iss 2, p 19 (2018)
Cluster analyses are often conducted with the goal to characterize an underlying probability density, for which the data-point density serves as an estimate for this probability density. We here test and benchmark the common nearest neighbor (CNN) cl
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/167843cdd2af4359af4de3ca4accf8c8
Autor:
Narayan, Brajesh
In this thesis, the aim is to contribute to the development of long-time methods for molecular dynamics (MD) simulations such as the Milestoning method and Markov State Model (MSM), and their application to study the conformational dynamics of system
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______1061::5adaa2258c17822e0cc02957508bfd00
We use an all-atom model of the human nicotinic acetylcholine receptor α7 in a conductive conformation, to provide the first available mapping of the potential of mean force for the ion translocation across the channel. The modeling is based on MD s
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______3658::bfb31047b117a9644fd42a0d15606e8f
http://hdl.handle.net/10447/522094
http://hdl.handle.net/10447/522094
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Journal of Chemical Information and Modeling
Molecular studies of human pentameric ligand-gated ion channels (LGICs) expressed in neurons and at neuromuscular junctions are of utmost importance in the development of therapeutic strategies for neurological disorders. We focus here on the nicotin
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::4e095dda8cc76814bcc195034a53549d
http://hdl.handle.net/10447/480596
http://hdl.handle.net/10447/480596