Zobrazeno 1 - 10
of 91
pro vyhledávání: '"lineage trees"'
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 25, Iss 1, Pp 1-14 (2024)
Abstract Background Cancers are spatially heterogenous, thus their clonal evolution, especially following anti-cancer treatments, depends on where the mutated cells are located within the tumor tissue. For example, cells exposed to different concentr
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/c5b39ee40d63426db1a417f59d4011d5
Autor:
Yunheng Han, Erin K. Molloy
Publikováno v:
Algorithms for Molecular Biology, Vol 18, Iss 1, Pp 1-14 (2023)
Abstract Cancer progression and treatment can be informed by reconstructing its evolutionary history from tumor cells. Although many methods exist to estimate evolutionary trees (called phylogenies) from molecular sequences, traditional approaches as
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/b383dd9fd4f24707be3c481ec7fd48e7
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 23, Iss 1, Pp 1-30 (2022)
Abstract We introduce CellPhy, a maximum likelihood framework for inferring phylogenetic trees from somatic single-cell single-nucleotide variants. CellPhy leverages a finite-site Markov genotype model with 16 diploid states and considers amplificati
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/39d57eb82a7e42ae8eecbcf60dd25483
Publikováno v:
Frontiers in Oncology, Vol 13 (2023)
IntroductionChronic lymphocytic leukemia (CLL) is the most common adult leukemia, accounting for 30–40% of all adult leukemias. The dynamics of B-lymphocyte CLL clones with mutated immunoglobulin heavy chain variable region (IgHV) genes in their tu
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/982618278d4d4b72bf1429514abef8ca
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 22, Iss 1, Pp 1-34 (2021)
Abstract Background Time-lapse microscopy live-cell imaging is essential for studying the evolution of bacterial communities at single-cell resolution. It allows capturing detailed information about the morphology, gene expression, and spatial charac
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/62f57035629e4717b38ab7df56e22e6d
Publikováno v:
Algorithms, Vol 15, Iss 2, p 51 (2022)
Motivation: Precise tracking of individual cells—especially tracking the family lineage, for example in a developing embryo—has widespread applications in biology and medicine. Due to significant noise in microscope images, existing methods have
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ff548117bf6a4430a57a8f1fc5ae334a
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.