Zobrazeno 1 - 10
of 117
pro vyhledávání: '"haplotype assembly"'
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 25, Iss 1, Pp 1-14 (2024)
Abstract Background The utilization of long reads for single nucleotide polymorphism (SNP) phasing has become popular, providing substantial support for research on human diseases and genetic studies in animals and plants. However, due to the complex
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/615f80da87744b40aefbb4b2fefe997c
Publikováno v:
Methods in Ecology and Evolution, Vol 14, Iss 5, Pp 1230-1244 (2023)
Abstract Organisms such as allopolyploids and F1 hybrids contain multiple distinct subgenomes, each potentially with its own evolutionary history. These organisms present a challenge for multilocus phylogenetic inference and other analyses since it i
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/5bbb3af417c44b5aba811646e30ad10b
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 21, Iss 1, Pp 1-15 (2020)
Abstract Background Single individual haplotype problem refers to reconstructing haplotypes of an individual based on several input fragments sequenced from a specified chromosome. Solving this problem is an important task in computational biology an
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/a4539965fbfb47eeb6371094bc3d0111
Publikováno v:
BMC Genomics, Vol 21, Iss S9, Pp 1-14 (2020)
Abstract Background Haplotypes, the ordered lists of single nucleotide variations that distinguish chromosomal sequences from their homologous pairs, may reveal an individual’s susceptibility to hereditary and complex diseases and affect how our bo
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/1096ed6c0a0a432db67b8c1e51efd7fd
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Andrea Tangherloni, Simone Spolaor, Leonardo Rundo, Marco S. Nobile, Paolo Cazzaniga, Giancarlo Mauri, Pietro Liò, Ivan Merelli, Daniela Besozzi
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 20, Iss S4, Pp 1-14 (2019)
Abstract Background In order to fully characterize the genome of an individual, the reconstruction of the two distinct copies of each chromosome, called haplotypes, is essential. The computational problem of inferring the full haplotype of a cell sta
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/3a3fab37dad84b53af785205d792e540
Autor:
Stefano Beretta, Murray D. Patterson, Simone Zaccaria, Gianluca Della Vedova, Paola Bonizzoni
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 19, Iss 1, Pp 1-19 (2018)
Abstract Background Haplotype assembly is the process of assigning the different alleles of the variants covered by mapped sequencing reads to the two haplotypes of the genome of a human individual. Long reads, which are nowadays cheaper to produce a
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/b98da28cb41a472cbd2c46df59744ea2
Publikováno v:
BMC Genomics, Vol 19, Iss S4, Pp 1-15 (2018)
Abstract Background Haplotype assembly is the task of reconstructing haplotypes of an individual from a mixture of sequenced chromosome fragments. Haplotype information enables studies of the effects of genetic variations on an organism’s phenotype
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/b7512e637063480fae57ee0a770ce17f