Zobrazeno 1 - 10 of 1 729 pro vyhledávání: '"de bruijn graph"'
1
Akademický článek
Repeat and haplotype aware error correction in nanopore sequencing reads with DeChat.
Autor: Liu, Yuansheng1 (AUTHOR), Li, Yichen1 (AUTHOR), Chen, Enlian2 (AUTHOR), Xu, Jialu2 (AUTHOR), Zhang, Wenhai2 (AUTHOR), Zeng, Xiangxiang1 (AUTHOR), Luo, Xiao2 (AUTHOR) xluo@hnu.edu.cn
Publikováno v: Communications Biology. 12/19/2024, Vol. 7 Issue 1, p1-10. 10p.
Zobrazit plný text záznamu
2
Akademický článek
Explorer: efficient DNA coding by De Bruijn graph toward arbitrary local and global biochemical constraints.
Autor: Dou, Chang1 (AUTHOR), Yang, Yijie1 (AUTHOR), Zhu, Fei1 (AUTHOR), Li, BingZhi2,3 (AUTHOR) yuping.duan@tju.edu.cn, Duan, Yuping1 (AUTHOR) yuping.duan@tju.edu.cn
Publikováno v: Briefings in Bioinformatics. Sep2024, Vol. 25 Issue 5, p1-10. 10p.
Zobrazit plný text záznamu
3
Akademický článek
Compression algorithm for colored de Bruijn graphs.
Autor: Rahman, Amatur1 (AUTHOR) amatur003@gmail.com, Dufresne, Yoann2,3 (AUTHOR), Medvedev, Paul1,4,5 (AUTHOR)
Publikováno v: Algorithms for Molecular Biology. 5/26/2024, Vol. 19 Issue 1, p1-11. 11p.
Zobrazit plný text záznamu
4
Akademický článek
Extensions on the Analysis of Elementary Cellular Automata with Process Graphs.
Autor: KASSARDJIAN, LIA1 liakassardjian@gmail.com, PAULO BALBI, PEDRO1,2 pp.balbi@gmail.com, RUIVO, EURICO1,2 eurico.ruivo@mackenzie.br
Publikováno v: Journal of Cellular Automata. 2024, Vol. 18 Issue 2/3, p127-155. 29p.
Zobrazit plný text záznamu
5
Akademický článek
CEMIG: prediction of the cis-regulatory motif using the de Bruijn graph from ATAC-seq.
Autor: Wang, Yizhong1 (AUTHOR), Li, Yang2 (AUTHOR), Wang, Cankun2 (AUTHOR), Lio, Chan-Wang Jerry2,3 (AUTHOR), Ma, Qin2,3 (AUTHOR) qin.ma@osumc.edu, Liu, Bingqiang1 (AUTHOR) qin.ma@osumc.edu
Publikováno v: Briefings in Bioinformatics. Jan2024, Vol. 25 Issue 1, p1-8. 8p.
Zobrazit plný text záznamu
6
Akademický článek
Fulgor: a fast and compact k-mer index for large-scale matching and color queries.
Autor: Fan, Jason1 (AUTHOR), Khan, Jamshed1 (AUTHOR), Singh, Noor Pratap1 (AUTHOR), Pibiri, Giulio Ermanno2,3 (AUTHOR), Patro, Rob1 (AUTHOR) rob@cs.umd.edu
Publikováno v: Algorithms for Molecular Biology. 1/23/2024, Vol. 19 Issue 1, p1-21. 21p.
Zobrazit plný text záznamu
7
Akademický článek
DeGeCI 1.1: a web platform for gene annotation of mitochondrial genomes.
Autor: Fiedler, Lisa1 (AUTHOR), Bernt, Matthias2 (AUTHOR), Middendorf, Martin1 (AUTHOR)
Publikováno v: Bioinformatics Advances. 2024, Vol. 4 Issue 1, p1-6. 6p.
Zobrazit plný text záznamu
8
Akademický článek
Graphs with the unique path property: Structure, cycles, factors, and constructions.
Autor: Etzion, Tuvi1 (AUTHOR) etzion@cs.technion.ac.il
Publikováno v: Journal of Graph Theory. Jan2024, Vol. 105 Issue 1, p5-33. 29p.
Zobrazit plný text záznamu
9
Akademický článek
PAPerFly: Partial Assembly-based Peak Finder for ab initio binding site reconstruction.
Autor: Faltejsková, Kateřina1,2 (AUTHOR) katerina.faltejskova@uochb.cas.cz, Vondrášek, Jiří1 (AUTHOR) jiri.vondrasek@uochb.cas.cz
Publikováno v: BMC Bioinformatics. 12/19/2023, Vol. 24 Issue 1, p1-15. 15p.
Zobrazit plný text záznamu
10
Akademický článek
On extremal factors of de Bruijn-like graphs.
Autor: Álvarez, Nicolás1 (AUTHOR) nico.alvarez@gmail.com, Becher, Verónica1,2 (AUTHOR) vbecher@dc.uba.ar, Mereb, Martín3 (AUTHOR) mmereb@gmail.com, Pajor, Ivo4 (AUTHOR) pajorivo@gmail.com, Soto, Carlos Miguel4 (AUTHOR) miguelsotocarlos@gmail.com
Publikováno v: Discrete Applied Mathematics. Nov2024, Vol. 357, p352-364. 13p.
Zobrazit plný text záznamu

Vyhledávací nástroje:

Upřesnit hledání

Omezení vyhledávání
Plný text Recenzováno Digitální knihovna AV ČR
Zdroje