Zobrazeno 1 - 10
of 43 159
pro vyhledávání: '"bayesian phylogenetic inference"'
Reconstructing the evolutionary history relating a collection of molecular sequences is the main subject of modern Bayesian phylogenetic inference. However, the commonly used Markov chain Monte Carlo methods can be inefficient due to the complicated
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2408.05058
Autor:
Brusselmans, Marius, Carvalho, Luiz Max, Hong, Samuel L., Gao, Jiansi, Matsen IV, Frederick A., Rambaut, Andrew, Lemey, Philippe, Suchard, Marc A., Dudas, Gytis, Baele, Guy
Modern phylogenetics research is often performed within a Bayesian framework, using sampling algorithms such as Markov chain Monte Carlo (MCMC) to approximate the posterior distribution. These algorithms require careful evaluation of the quality of t
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2402.11657
We present VBPI-Mixtures, an algorithm designed to enhance the accuracy of phylogenetic posterior distributions, particularly for tree-topology and branch-length approximations. Despite the Variational Bayesian Phylogenetic Inference (VBPI), a leadin
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2310.00941
Publikováno v:
Open Research Europe, Vol 3 (2024)
Phylogenetic estimation is, and has always been, a complex endeavor. Estimating a phylogenetic tree involves evaluating many possible solutions and possible evolutionary histories that could explain a set of observed data, typically by using a model
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/9fd54c1874ea4f378ad582ecc752b10f
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Open Research Europe, Vol 3 (2024)
Phylogenetic estimation is, and has always been, a complex endeavor. Estimating a phylogenetic tree involves evaluating many possible solutions and possible evolutionary histories that could explain a set of observed data, typically by using a model
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/70985f0e4cc14f5d8786604f41089c0e
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Zhang, Cheng, Matsen IV, Frederick A.
Bayesian phylogenetic inference is currently done via Markov chain Monte Carlo (MCMC) with simple proposal mechanisms. This hinders exploration efficiency and often requires long runs to deliver accurate posterior estimates. In this paper, we present
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2204.07747
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.