Zobrazeno 1 - 10
of 203
pro vyhledávání: '"absolute abundance"'
Autor:
Qingchen Xiao, Boyan Wang, Zishan Li, Zihua Zhang, Kailing Xie, Jing Zhou, Keqing Lin, Xiaowan Geng, Xiaoyu Li, Jin Chen
Publikováno v:
Resources, Environment and Sustainability, Vol 17, Iss , Pp 100164- (2024)
Heavy metal (HM) contamination affects the composition and structure of soil microbial communities, but there are few studies on the assembly process and co-occurrence network of soil microbial community succession driven by Cd in volcanic ecosystem.
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/c6ede7cf3fdb475ea1496cbc4b7dd165
Autor:
Marjolein Bruijning, Julien F. Ayroles, Lucas P. Henry, Britt Koskella, Kyle M. Meyer, C. Jessica E. Metcalf
Publikováno v:
Microbiome, Vol 11, Iss 1, Pp 1-14 (2023)
Abstract Background Host genetics can shape microbiome composition, but to what extent it does, remains unclear. Like any other complex trait, this important question can be addressed by estimating the heritability (h 2 ) of the microbiome—the prop
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ca9177b064f445269dc3911d7920d256
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
synDNA—a Synthetic DNA Spike-in Method for Absolute Quantification of Shotgun Metagenomic Sequencing
Publikováno v:
mSystems, Vol 7, Iss 6 (2022)
ABSTRACT Microbiome studies have the common goal of determining which microbial taxa are present, respond to specific conditions, or promote phenotypic changes in the host. Most of these studies rely on relative abundance measurements to drive conclu
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/452e62cdad074fd0b3173b0669cfd58a
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Microbiome, Vol 8, Iss 1, Pp 1-16 (2020)
Abstract Background Human-targeted drugs may exert off-target effects or can be repurposed to modulate the gut microbiota. However, our understanding of such effects is limited due to a lack of rapid and scalable assay to comprehensively assess micro
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/acd0b02b76fa49b2bcf992e8a5839543
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Ju Yeong Kim, Myung‐hee Yi, Myungjun Kim, Seogwon Lee, Hye Su Moon, Dongeun Yong, Tai‐Soon Yong
Publikováno v:
MicrobiologyOpen, Vol 10, Iss 4, Pp n/a-n/a (2021)
Abstract High‐throughput sequencing (HTS) of 16S rRNA gene amplicons provides compositional information regarding the microbial community, but not the absolute abundance of the bacteria. We aimed to develop a standardized method for quantifying the
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/6862f65ffdde4050a6f950f365bf76b5
Autor:
Derek S Lundberg, Pratchaya Pramoj Na Ayutthaya, Annett Strauß, Gautam Shirsekar, Wen-Sui Lo, Thomas Lahaye, Detlef Weigel
Publikováno v:
eLife, Vol 10 (2021)
The ratio of microbial population size relative to the amount of host tissue, or ‘microbial load’, is a fundamental metric of colonization and infection, but it cannot be directly deduced from microbial amplicon data such as 16S rRNA gene counts.
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/ef683d00321945a8bcfe93a7820b23af