Application of Gene Expression Trajectories Initiated from ErbB Receptor Activation Highlights the Dynamics of Divergent Promoter Usage

Autor: Alistair R, R.F., Hideya, K., Michael, R., J Kenneth Baillie, Michiel J, L.D.H., Vanja, H., Timo, L., Ivan, V.K., Marina, L., Masayoshi, I., Robin, A., Christopher, J.M., Terrence, F.M., Sebastian, S., Nicolas, B., Mette, J., Emmanuel, D., Erik, A., Christian, S., Ulf, S., Yulia, A.M., Charles, P., Morana, V., Jessica, S., Colin, A.S., Yuri, I., Margherita, F., Intikhab, A., Davide, A., Gabriel, M.A., John A, C.A., Peter, A., Magda, B., Sarah, B., Piotr, J.B., Anthony, G.B., Swati, P., Judith, A.B., Antje, B., Bodega, B., Alessandro, B., James, B., Frank, B., A Maxwell Burroughs, Andrea, C., Carlo, V.C., Daniel, C., Yun, C., Marco, C., Yari, C., Hans, C.C., Emiliano, D., Carrie, A.D., Bart, D., Michael, D., Alexander, D.D., Taeko, D., Finn, D., Albert S, B.E., Matthias, E., Karl, E., Mitsuhiro, E., Hideki, E., Michela, F., Lynsey, F., Hai, F., Mary, C.F., Geoffrey, J.F., Alexander, V.F., Malcolm, E.F., Martin, C.F., Rie, F., Shiro, F., Cesare, F., Masaaki, F., Jun-ichi, F., Teunis, B.G., Andrew, G., Thomas, G., Daniel, G., Julian, G., Sven, G., Reto, G., Stefano, G., Thomas, J.H., Masahide, H., Mitsuko, H., Matthias, H., Jayson, H., Akira, H., Yuki, H., Takehiro, H., Meenhard, H., Kelly, J.H., Shannan, J.H.S., Oliver, M.H., Ilka, H., Fumi, H., Lukasz, H., Kei, I., Tomokatsu, I., Boris, R.J., Hui, J., Anagha, J., Giuseppe, J., Bogumil, K., Chieko, K., Kaoru, K., Kaiho, A., Kazuhiro, K., Mutsumi, K., Artem, S.K., Takeya, K., Shintaro, K., Sachi, K., Shuji, K., Hiroshi, K., Yuki, I.K., Tsugumi, K., Judith, S.K., Tony, J.K., Juha, K., Levon, M.K., Toshio, K., S Peter Klinken, Alan, J.K., Miki, K., Soichi, K., Naoto, K., Haruhiko, K., Shigeo, K., Sarah, K., Atsutaka, K., Andrew, T.K., Jeroen F, J.L., Weonju, L., Andreas, L., Kang, L., Berit, L., Leonard, L., Alan, M., Ri-ichiroh, M., Jessica, C.M., Benoit, M., Anthony, M., Niklas, M., Alison, M., Yosuke, M., David, A.D.L.M., Hiromasa, M., Mitsuru, M., Kazuyo, M., Efthymios, M., Hozumi, M., Christine, L.M., Mitsuyoshi, M., Sayaka, N., Yutaka, N., Fumio, N., Toshiyuki, N., Yukio, N., Kenichi, N., Erik van Nimwegen, Noriko, N., Hiromi, N., Shohei, N., Tadasuke, N., Soichi, O., Naganari, O., Hiroko, O., Hiroshi, O., Mitsuhiro, O., Mariko, O., Yasushi, O., Valerio, O., Dmitry, A.O., Arnab, P., Robert, P., Margaret, P., Helena, P., Silvano, P., James G, D.P., Owen J, L.R., Jordan, A.R., Mamoon, R., Timothy, R., Patrizia, R., Marco, R., Sugata, R., Morten, B.R., Eri, S., Antti, S., Akiko, S., Shimon, S., Mizuho, S., Hiroki, S., Hironori, S., Suzana, S., Alka, S., Claudio, S., Erik, A.S., Gundula, G.S., Anita, S., Thierry, S., Guojun, S., Hisashi, S., Yishai, S., Jay, W.S., Christophe, S., Daisuke, S., Takaaki, S., Masanori, S., Rolf, K.S., Peter A, C.'.H., Michihira, T., Naoko, T., Jun, T., Hiroshi, T., Hideki, T., Zuotian, T., Mark, T., Hiroo, T., Tetsuro, T., Eivind, V., Marc van de Wetering, Linda, M.V.D.B., Roberto, V., Dipti, V., Ilya, E.V., Wyeth, W.W., Shoko, W., Christine, A.W., Louise, N.W., Ernst, W., Emily, J.W., Yoko, Y., Masayuki, Y., Misako, Y., Yohei, Y., Shigehiro, Y., Suzan, E.Z., Peter, G.Z., Xiaobei, Z., Silvia, Z., Kim, M.S., Harukazu, S., Carsten, O.D., Jun, K., Peter, H., Winston, H., Tom, C.F., Boris, L., Vladimir, B.B., Martin, S.T., Vsevolod, J.M., Albin, S., David, A.H., Piero, C., Yoshihide Hayashizaki Carbajo, D., Magi, S., Itoh, M., Kawaji, H., Lassmann, T., Arner, E., Forrest, A.R.R., Carninci, P., Hayashizaki, Y., Daub, C.O., Okada-Hatakeyama, M., Mar, J.C.

Publikováno v: PLoS ONE
PLoS ONE, Vol 10, Iss 12, p e0144176 (2015)
PLoS One, 10(12). Public Library of Science
PLoS ONE, 10(12). Public Library of Science

Understanding how cells use complex transcriptional programs to alter their fate in response to specific stimuli is an important question in biology. For the MCF-7 human breast cancer cell line, we applied gene expression trajectory models to identif

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