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Aggregate and Heatmap Representations of Genome-Wide Localization Data Using VAP, a Versatile Aggregate Profiler

Autor: François Robert, Mylène Brunelle, Marc-Antoine Robert, Pierre-Étienne Jacques, Charles Coulombe, Christian Poitras, Alexei Nordell Markovits

Publikováno v: Methods in Molecular Biology ISBN: 9781493928767

In the analysis of experimental data corresponding to the signal enrichment of chromatin features such as histone modifications throughout the genome, it is often useful to represent the signal over known regions of interest, such as genes, using agg

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::b9a39e121534237c25fbc4e198e0aded
https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2877-4_18

Aggregate and Heatmap Representations of Genome-Wide Localization Data Using VAP, a Versatile Aggregate Profiler.

Autor: Brunelle M; Département de biologie, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1., Coulombe C; Département d'informatique, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1., Poitras C; Institut de recherches cliniques de Montréal, 110 Av des Pins Ouest, Montréal, QC, Canada, H2W 1R7., Robert MA; Département de biologie, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1., Markovits AN; Département de biologie, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1., Robert F; Institut de recherches cliniques de Montréal, 110 Av des Pins Ouest, Montréal, QC, Canada, H2W 1R7.; Département de médecine, Faculté de médecine, Université de Montréal, 2900 boul. Edouard-Montpetit, Montréal, QC, H3T 1J4, Canada., Jacques PÉ; Département de biologie, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1. pierre-etienne.jacques@usherbrooke.ca.; Département d'informatique, Faculté des sciences, Université de Sherbrooke, 2500 boul. de l'Université, Sherbrooke, QC, Canada, J1K 2R1. pierre-etienne.jacques@usherbrooke.ca.; Centre de recherche du Centre hospitalier universitaire de Sherbrooke, 3001, 12e Avenue Nord, Sherbrooke, QC, Canada, J1H 5N4. pierre-etienne.jacques@usherbrooke.ca.

Publikováno v: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) [Methods Mol Biol] 2015; Vol. 1334, pp. 273-98.

Développement de méthodes et d'outils bio-informatiques pour l'analyse de données génomiques

Autor: Coulombe, Charles

Dans ce mémoire, je présenterai les outils que nous avons développés dans le cadre de ma maîtrise. Tout d'abord, je présenterai un outil d'analyse de données génomiques nommé Versatile Aggregrate Profiler (VAP). Ensuite, je présenterai un o

Externí odkaz: http://hdl.handle.net/11143/10519

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