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Prediction of strain level phage-host interactions across the Escherichia genus using only genomic information.

Autor: Gaborieau B; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France. baptiste.gaborieau@aphp.fr.; AP-HP, Hôpital Louis Mourier, DMU ESPRIT, Service de Médecine Intensive Réanimation, Colombes, France. baptiste.gaborieau@aphp.fr.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR6047, Microbiologie Intégrative et Moléculaire, Bacteriophage Bacterium Host, Paris, France. baptiste.gaborieau@aphp.fr., Vaysset H; AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Paris, France.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, INSERM U1284, SEED, Molecular Diversity of Microbes lab, Paris, France.; Institut Curie, Université PSL, Sorbonne Université, CNRS UMR168, Laboratoire Physico Chimie Curie, Paris, France., Tesson F; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France.; Institut Pasteur, Université Paris Cité, INSERM U1284, SEED, Molecular Diversity of Microbes lab, Paris, France., Charachon I; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France., Dib N; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France., Bernier J; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France., Dequidt T; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR6047, Microbiologie Intégrative et Moléculaire, Bacteriophage Bacterium Host, Paris, France., Georjon H; Institut Pasteur, Université Paris Cité, INSERM U1284, SEED, Molecular Diversity of Microbes lab, Paris, France., Clermont O; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France., Hersen P; Institut Curie, Université PSL, Sorbonne Université, CNRS UMR168, Laboratoire Physico Chimie Curie, Paris, France., Debarbieux L; Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR6047, Microbiologie Intégrative et Moléculaire, Bacteriophage Bacterium Host, Paris, France., Ricard JD; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France.; AP-HP, Hôpital Louis Mourier, DMU ESPRIT, Service de Médecine Intensive Réanimation, Colombes, France., Denamur E; Université Paris Cité, INSERM, UMR1137, IAME, Paris, France.; AP-HP, Hôpital Bichat, Laboratoire de Génétique Moléculaire, Paris, France., Bernheim A; Institut Pasteur, Université Paris Cité, INSERM U1284, SEED, Molecular Diversity of Microbes lab, Paris, France. aude.bernheim@pasteur.fr.

Publikováno v: Nature microbiology [Nat Microbiol] 2024 Nov; Vol. 9 (11), pp. 2847-2861. Date of Electronic Publication: 2024 Oct 31.