Zobrazeno 1 - 10
of 23
pro vyhledávání: '"Unitig"'
Publikováno v:
Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol 23, Iss , Pp 1864-1876 (2024)
In current genomic research, the widely used methods for predicting antimicrobial resistance (AMR) often rely on prior knowledge of known AMR genes or reference genomes. However, these methods have limitations, potentially resulting in imprecise pred
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/100ce892bd804cb6a8d64d3906990907
Publikováno v:
Frontiers in Microbiology, Vol 14 (2023)
Quinolone resistance presents a growing global health threat. We employed word-based GWAS to explore genomic data, aiming to enhance our understanding of this phenomenon. Unlike traditional variant-based GWAS analyses, this approach simultaneously ca
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/e8b19c1843984d5e9538fa3070fb48ec
Publikováno v:
Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol 21, Iss , Pp 2394-2404 (2023)
De novo assembly of next generation metagenomic reads is widely used to provide taxonomic and functional information of genomes in a microbial community. As strains are functionally specific, recovery of strain-resolved genomes is important but still
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/0ab827d68318456692531c6898c82d57
Publikováno v:
Genome Biology, Vol 23, Iss 1, Pp 1-32 (2022)
Abstract The de Bruijn graph is a key data structure in modern computational genomics, and construction of its compacted variant resides upstream of many genomic analyses. As the quantity of genomic data grows rapidly, this often forms a computationa
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/2703e9a921a44a128101d491a0a0481e
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
Journal of Bioinformatics and Computational Biology, World Scientific Publishing, In press, pp.1-28. ⟨10.1142/S0219720019500148⟩
Journal of Bioinformatics and Computational Biology, In press, pp.1-28. ⟨10.1142/S0219720019500148⟩
Journal of Bioinformatics and Computational Biology, World Scientific Publishing, In press, pp.1-28. ⟨10.1142/S0219720019500148⟩
Journal of Bioinformatics and Computational Biology, In press, pp.1-28. ⟨10.1142/S0219720019500148⟩
International audience; This paper focuses on the last two stages of genome assembly, namely, scaffolding and gap-filling, and shows that they can be solved as part of a single optimization problem. Our approach is based on modeling genome assembly a
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::23110c6b462b32386e3a426a28b9eb53
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31288643
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31288643