Zobrazeno 1 - 9
of 9
pro vyhledávání: '"U. Laverty"'
Autor:
Debashish Ray, Kaitlin U. Laverty, Arttu Jolma, Kate Nie, Reuben Samson, Sara E. Pour, Cyrus L. Tam, Niklas von Krosigk, Syed Nabeel-Shah, Mihai Albu, Hong Zheng, Gabrielle Perron, Hyunmin Lee, Hamed Najafabadi, Benjamin Blencowe, Jack Greenblatt, Quaid Morris, Timothy R. Hughes
Publikováno v:
Scientific Reports, Vol 13, Iss 1, Pp 1-15 (2023)
Abstract Thousands of RNA-binding proteins (RBPs) crosslink to cellular mRNA. Among these are numerous unconventional RBPs (ucRBPs)—proteins that associate with RNA but lack known RNA-binding domains (RBDs). The vast majority of ucRBPs have unchara
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/1bc102f75ce84e278ddced7e0d6825bd
Autor:
Kaitlin U Laverty, Arttu Jolma, Sara E Pour, Hong Zheng, Debashish Ray, Quaid Morris, Timothy R Hughes
Publikováno v:
Nucleic acids research. 50(19)
Modelling both primary sequence and secondary structure preferences for RNA binding proteins (RBPs) remains an ongoing challenge. Current models use varied RNA structure representations and can be difficult to interpret and evaluate. To address these
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::4339e3c9a774c406e867d2ae4da84e9f
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36018788
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36018788
Autor:
Shankar Vembu, Timothy P. Hughes, Quaid Morris, Kate B. Cook, Hong Zheng, Debashish Ray, Kevin C.H. Ha, Kaitlin U. Laverty
Publikováno v:
Methods. 126:18-28
RNA-binding proteins recognize RNA sequences and structures, but there is currently no systematic and accurate method to derive large (>12base) motifs de novo that reflect a combination of intrinsic preference to both sequence and structure. To addre
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::b584223aa4ddff5e141a5bd12200d048
https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2017.06.024
https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2017.06.024
Autor:
Larry Holbrook, Timothy P. Hughes, Gintaras Deikus, Robert Sebra, Kaitlin U. Laverty, Jake Stout, Hardik Shah, Jonathan E. Page, Mitchell J. Sullivan, Harm van Bakel, Navdeep Gill
Cannabis sativa is widely cultivated for medicinal, food, industrial, and recreational use, but much remains unknown regarding its genetics, including the molecular determinants of cannabinoid content. Here, we describe a combined physical and geneti
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::33bd12cad0232e2ebba4331af963dc16
https://europepmc.org/articles/PMC6314170/
https://europepmc.org/articles/PMC6314170/
Publikováno v:
Current opinion in structural biology. 53
Identifying the binding preferences of RNA-binding proteins (RBPs) is important in understanding their contribution to post-transcriptional regulation. Here, we review the current state-of-the art of RNA motif identification tools for RBPs. New in vi
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::c8030c03078eea6144fa358e3151afc3
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30172081
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30172081
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Age and Ageing. 43:i7-i7
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::85adab33f4182de7e55ec089316df02f
https://doi.org/10.1093/ageing/afu036.30
https://doi.org/10.1093/ageing/afu036.30
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.