Zobrazeno 1 - 8
of 8
pro vyhledávání: '"Taxonomy annotation"'
Autor:
Tsunglin Liu, Chen-Yu Chen, An Chen-Deng, Yi-Lin Chen, Jiu-Yao Wang, Yung-I Hou, Min-Ching Lin
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 21, Iss 1, Pp 1-13 (2020)
Abstract Background Illumina sequencing of a marker gene is popular in metagenomic studies. However, Illumina paired-end (PE) reads sometimes cannot be merged into single reads for subsequent analysis. When mergeable PE reads are limited, one can sim
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/e34aa4cc8cf74f6991cd10c57cc63882
Publikováno v:
BMC Genomics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-16 (2019)
Abstract Background Reads assignment to taxonomic units is a key step in microbiome analysis pipelines. To date, accurate taxonomy annotation of 16S reads, particularly at species rank, is still challenging due to the short size of read sequences and
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/02aec56950ef4e8da1219debdb18793b
Autor:
Yung I. Hou, Jiu Yao Wang, Chen Yu Chen, Yi Lin Chen, Min Ching Lin, Tsunglin Liu, An Chen-Deng
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 21, Iss 1, Pp 1-13 (2020)
BMC Bioinformatics
BMC Bioinformatics
Background Illumina sequencing of a marker gene is popular in metagenomic studies. However, Illumina paired-end (PE) reads sometimes cannot be merged into single reads for subsequent analysis. When mergeable PE reads are limited, one can simply use o
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::566bf4f104de61baf7c9f018a6e8d944
http://link.springer.com/article/10.1186/s12859-020-3445-6
http://link.springer.com/article/10.1186/s12859-020-3445-6
Publikováno v:
BMC Genomics
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.560. ⟨10.1186/s12864-019-5914-8⟩
BMC Genomics 1 (20), 560. (2019)
5. Colloque de Génomique Environnementale
5. Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2019, La Rochelle, France
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.560
BMC Genomics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-16 (2019)
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.560. ⟨10.1186/s12864-019-5914-8⟩
BMC Genomics 1 (20), 560. (2019)
5. Colloque de Génomique Environnementale
5. Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2019, La Rochelle, France
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), pp.560
BMC Genomics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-16 (2019)
Background Reads assignment to taxonomic units is a key step in microbiome analysis pipelines. To date, accurate taxonomy annotation of 16S reads, particularly at species rank, is still challenging due to the short size of read sequences and differen
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::9ec4296f1dbd559de234683c5db99b54
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02187459/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02187459/document
Publikováno v:
5. Colloque de Génomique Environnementale, La Rochelle, FRA, 2019-10-08-2019-10-10
New sequencing technologies allowed the development of methods such as metabarcoding. They use 16S rRNA, the ubiquitous gene of the bacteria domain, as a biomarker to study bacterial communities from samples of complex environments. The bioinformatic
Externí odkaz:
https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______1582::6f842c82bceea4f28046c8c11fa313ba
http://prodinra.inra.fr/record/487134
http://prodinra.inra.fr/record/487134
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Conference
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.