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Dissertation/ Thesis
Reconstruction de profils protéiques pour la recherche de biomarqueurs
Autor: Szacherski, Pascal
Cette thèse préparée au CEA Leti, Minatec Campus, Grenoble, et à l’IMS, Bordeaux, s’inscrit dans le thème du traitement de l’information pour des données protéomiques. Nous cherchons à reconstruire des profils protéiques à partir des
Externí odkaz: http://www.theses.fr/2012BOR14740/document
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Report
Bayesian hierarchical reconstruction of protein profiles including a digestion model
Autor: Grangeat, Pierre, Szacherski, Pascal, Gerfault, Laurent, Giovannelli, Jean-François
Introduction : Mass spectrometry approaches are very attractive to detect protein panels in a sensitive and high speed way. MS can be coupled to many proteomic separation techniques. However, controlling technological variability on these analytical
Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/1202.4868
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Reconstruction of proteomic profiles for biomarker discovery
Autor: SZACHERSKI, Pascal
Publikováno v: Traitement du signal et de l'image [eess.SP]. Université Sciences et Technologies-Bordeaux I, 2012. Français
This thesis has been prepared at the CEA Léti, Minatec Campus, (Grenoble, France) and the IMS (Bordeaux, France) in the field of information and signal processing of proteomic data. The aim is to reconstruct the proteomic profile from the data provi
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::3b49da88dc0fdab1bb4eb429eafcc543
https://theses.hal.science/tel-00788410
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Apprentissage supervisé robuste de caractéristiques de classes. Application en protéomique
Autor: Szacherski, Pascal, Giovannelli, Jean-François, Gerfault, Laurent, Grangeat, Pierre
Publikováno v: GRETSI
Apprentissage supervisé robuste de caractéristiques de classes. Application en protéomique
GRETSI, 2011, France. pp
National audience; La protéomique est un domaine en pleine expansion, et son utilisation est notamment envisagée dans le diagnostic de maladies comme le cancer. Un diagnostic basé sur une classification nécessite la connaissance des distributions
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::87dd2d30c476cf62616e5341576fc1ee
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00585531
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Convergence entre l’analyse biostatistique et les méthodes d’inversion hiérarchique bayésienne pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse
Autor: Grangeat, Pierre, Giovannelli, Jean-François, Roy, Pascal, Picaud, Vincent, Truntzer, Caroline, Lemoine, Jérôme, Mahé, Pierre, Charrier, Jean-Philippe, Gerfault, Laurent, Szacherski, Pascal, Giremus, Audrey, Dridi, Noura, Klich, Amna, Mercier, Catherine, Maucort-Boulch, Delphine, Gal, Olivier, Ducoroy, Patrick, Salvador, Arnaud, Fortin, Tanguy, Choquet-Kastylevsky, Geneviève, Lacroix, Bruno
Publikováno v: GRETSI
24° Colloque sur le traitement du signal et des images
24° Colloque sur le traitement du signal et des images, SFGBM (Société Française du génie biologique et médical), Sep 2013, Brest, France
International audience; In this communication, we are presenting an overview on the methods in biostatistical analysis and Bayesian hierarchical inversion we are studying on the BHI-PRO project for research and validation of biomarkers based on mass
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______3515::d672f7d668973a50c28bce77818b7fed
https://cea.hal.science/cea-03996401/document
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MRM protein quantification and serum sample classification
Autor: Szacherski, Pascal, Gerfault, Laurent, Giovannelli, Jean-François, Giremus, Audrey, Mahé, Pierre, Fortin, Tanguy, Choquet, Geneviève, Klich, Amna, Mercier, Catherine, Roy, Pascal, Salvador, Arnaud, Lemoine, Jérôme, Charrier, Jean-Philippe, Lacroix, Bruno, Grangeat, Pierre
Publikováno v: 61st conference of the American Society of Mass Spectrometry
61st conference of the American Society of Mass Spectrometry, Jun 2013, Minneapolis, United States
Quantification and classification are key points for differential analysis of proteomic studies and diagnostic tests. A MRM analytical chain is a cascade of molecular events depicted by a graph structure, each node being associated to a molecular sta
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::4e4191acf876395d220f953d9b0692a0
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875/document
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Akademický článek
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Robust MS serum sample classification in proteomics by the use of inverse problems
Autor: Laurent Gerfault, Pascal Szacherski, Audrey Giremus, Pierre Grangeat, Jean-François Giovannelli
Publikováno v: GENSiPS
Proceedings of the 2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics
2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics
2012 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, Dec 2012, Washington, DC, United States
International audience; In this communication, we address the problem of robust classification of proteomic serum samples. We propose coupling classification with the inverse problem methodology. The analytical chain comprising a liquid chromatograph
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::31b1f6f838a9aeb50102df008eeca565
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00744709
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