Zobrazeno 1 - 10
of 114
pro vyhledávání: '"Swenson, Krister M."'
Autor:
Swenson, Krister M.
In 1937, biologists Sturtevant and Tan posed a computational question: transform a chromosome represented by a permutation of genes, into a second permutation, using a minimum-length sequence of reversals, each inverting the order of a contiguous sub
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2403.20165
The study of genome rearrangement has many flavours, but they all are somehow tied to edit distances on variations of a multi-graph called the breakpoint graph. We study a weighted 2-break distance on Eulerian 2-edge-colored multi-graphs, which gener
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1802.07515
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Swenson Krister M, El-Mabrouk Nadia
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 13, Iss Suppl 19, p S15 (2012)
Abstract Background Reconciliation is the classical method for inferring a duplication and loss history from a set of extant genes. It is based upon the notion of embedding the gene tree into the species tree, the incongruence between the two indicat
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/9b16f60f51544feca5763cbe6702cd7e
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 13, Iss Suppl 19, p S16 (2012)
Abstract Understanding the history of a gene family that evolves through duplication, speciation, and loss is a fundamental problem in comparative genomics. Features such as function, position, and structural similarity between genes are intimately c
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/dd94a491a5394dd29d5ed738ff771a93
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 11, Iss Suppl 1, p S54 (2010)
Abstract Background The rapidly increasing availability of whole-genome sequences has enabled the study of whole-genome evolution. Evolutionary mechanisms based on genome rearrangements have attracted much attention and given rise to many models; som
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/8834c59a65de4918a145366e7c9fbfe1
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Moret Bernard ME, Swenson Krister M
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 10, Iss Suppl 1, p S7 (2009)
Abstract Background Reconstructing complete ancestral genomes (at least in terms of their gene inventory and arrangement) is attracting much interest due to the rapidly increasing availability of whole genome sequences. While modest successes have be
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/57a2310a14614fd689b0b10a64282898
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 10, Iss Suppl 1, p S6 (2009)
Abstract Background Given three signed permutations, an inversion median is a fourth permutation that minimizes the sum of the pairwise inversion distances between it and the three others. This problem is NP-hard as well as hard to approximate. Yet m
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/af9815149ea04c6eaa4c344b57c95733
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.