Výsledky vyhledávání

Akademický článek

Fast and accurate short-read alignment with hybrid hash-tree data structure

Autor: Junichiro Makino, Toshikazu Ebisuzaki, Ryutaro Himeno, Yoshihide Hayashizaki

Publikováno v: Genomics & Informatics, Vol 22, Iss 1, Pp 1-10 (2024)

Abstract Rapidly increasing the amount of short-read data generated by NGSs (new-generation sequencers) calls for the development of fast and accurate read alignment programs. The programs based on the hash table (BLAST) and Burrows-Wheeler transform

Externí odkaz: https://doaj.org/article/bc2b53d30bf04e8d835215d9a284c30e

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

Optimizing Data Parallelism for FM-Based Short-Read Alignment on the Heterogeneous Non-Uniform Memory Access Architectures.

Autor: Chen, Shaolong^1,2 (AUTHOR) daiyz@jxnu.edu.cn, Dai, Yunzi¹ (AUTHOR) mikel@jxnu.edu.cn, Liu, Liwei¹ (AUTHOR) xintingyu@jxnu.edu.cn, Yu, Xinting¹ (AUTHOR)

Publikováno v: Future Internet. Jun2024, Vol. 16 Issue 6, p217. 18p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Short-read full-length 16S rRNA amplicon sequencing for characterisation of the respiratory bacteriome of captive and free-ranging African elephants (Loxodonta africana).

Autor: Martin, Lauren C.^1,2,3 (AUTHOR), O'Hare, Michaela A.^2,3 (AUTHOR), Ghielmetti, Giovanni^4,5 (AUTHOR), Twesigomwe, David^6,7 (AUTHOR), Kerr, Tanya J.⁴ (AUTHOR), Gumbo, Rachiel⁴ (AUTHOR), Buss, Peter E.⁸ (AUTHOR), Kitchin, Natasha^1,2 (AUTHOR), Hemmings, Sian M. J.^1,2 (AUTHOR), Miller, Michele A.⁴ (AUTHOR), Goosen, Wynand J.⁴ (AUTHOR) wjgoosen@sun.ac.za

Publikováno v: Scientific Reports. 6/26/2024, Vol. 14 Issue 1, p1-13. 13p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

METASEED: a novel approach to full-length 16S rRNA gene reconstruction from short read data.

Autor: Philip, Melcy¹ (AUTHOR) philip.melcy@nmbu.no, Rudi, Knut¹ (AUTHOR), Ormaasen, Ida¹ (AUTHOR), Angell, Inga Leena¹ (AUTHOR), Pettersen, Ragnhild² (AUTHOR), Keeley, Nigel B.³ (AUTHOR), Snipen, Lars-Gustav¹ (AUTHOR)

Publikováno v: BMC Bioinformatics. 7/12/2024, Vol. 25 Issue 1, p1-16. 16p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

De novo assembly of transcriptomes and differential gene expression analysis using short-read data from emerging model organisms – a brief guide.

Autor: Jackson, Daniel J.¹ (AUTHOR) djackso@gwdg.de, Cerveau, Nicolas¹ (AUTHOR), Posnien, Nico² (AUTHOR) nposnie@gwdg.de

Publikováno v: Frontiers in Zoology. 6/20/2024, Vol. 21 Issue 1, p1-18. 18p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Comprehensive Analysis of the Genetic Variation in the LPA Gene from Short-Read Sequencing.

Autor: Betschart, Raphael O.¹, Koliopanos, Georgios¹, Garg, Paras², Guo, Linlin³, Rossi, Massimiliano⁴, Schönherr, Sebastian⁵, Blankenberg, Stefan^3,6,7, Twerenbold, Raphael^3,6,7, Zeller, Tanja^3,6,7, Ziegler, Andreas^1,3,6,8 ziegler.lit@mailbox.org

Publikováno v: BioMed. Jun2024, Vol. 4 Issue 2, p156-170. 15p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Vyhledávací nástroje:

Upřesnit hledání