Zobrazeno 1 - 10
of 107
pro vyhledávání: '"Shao, Mingfu"'
Autor:
Li, Xiang, Shao, Mingfu
The high-throughput short-reads RNA-seq protocols often produce paired-end reads, with the middle portion of the fragments being unsequenced. We explore if the full-length fragments can be computationally reconstructed from the sequenced two ends in
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2303.15594
In computational biology, $k$-mers and edit distance are fundamental concepts. However, little is known about the metric space of all $k$-mers equipped with the edit distance. In this work, we explore the structure of the $k$-mer space by studying it
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2303.10926
Autor:
Chen, Ke, Shao, Mingfu
Many bioinformatics applications involve bucketing a set of sequences where each sequence is allowed to be assigned into multiple buckets. To achieve both high sensitivity and precision, bucketing methods are desired to assign similar sequences into
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/2206.03097
Autor:
Zhang, Qimin1 (AUTHOR), Shao, Mingfu1,2 (AUTHOR) mxs2589@psu.edu
Publikováno v:
PLoS Computational Biology. 12/21/2023, Vol. 19 Issue 12, p1-20. 20p.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Protein structure prediction remains to be an open problem in bioinformatics. There are two main categories of methods for protein structure prediction: Free Modeling (FM) and Template Based Modeling (TBM). Protein threading, belonging to the categor
Externí odkaz:
http://arxiv.org/abs/1509.03434
Autor:
Chen, Ke1 (AUTHOR), Shao, Mingfu1,2 (AUTHOR) mxs2589@psu.edu
Publikováno v:
Algorithms for Molecular Biology. 7/24/2023, Vol. 18 Issue 1, p1-13. 13p.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Publikováno v:
Algorithms for Molecular Biology. 5/23/2020, Vol. 15 Issue 1, p1-12. 12p.