Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Reproducibility of high-throughput mRNA and small RNA sequencing across laboratories

Autor: 't Hoen PA, Friedlxe4nder MR, Almlxf6f J, Sammeth M, Pulyakhina I, Anvar SY, Laros JF, Buermans HP, Karlberg O, Brxe4nnvall M, GEUVADIS Consortium, den Dunnen JT, van Ommen GJ, Gut IG, Guigxf3 R, Estivill X, Syvxe4nen AC, Dermitzakis ET, Lappalainen T, 't Hoen PA, Friedlxe4nder MR, Almlxf6f J, Sammeth M, Pulyakhina I, Anvar SY, Laros JF, Buermans HP, Karlberg O, Brxe4nnvall M, GEUVADIS Consortium, den Dunnen JT, van Ommen GJ, Gut IG, Guigxf3 R, Estivill X, Syvxe4nen AC, Dermitzakis ET, Lappalainen T

Publikováno v: Nature Biotechnology.

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=erc_________::70dea3d79724cf019f72d7e47d6c3d6c

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Assessment of transcript reconstruction methods for RNA-seq

Autor: Steijger, T., Abril, J.F., Engström, P.G., Kokocinski, F., Akerman, M., Alioto, T., Ambrosini, G., Antonarakis, S.E., Behr, J., Bertone, P., Bohnert, R., Bucher, P., Cloonan, N., Derrien, T., Djebali, S., Du, J., Dudoit, S., Gerstein, M., Gingeras, T.R., Gonzalez, D., Grimmond, S.M., Guigó, R., Habegger, L., Harrow, J., Hubbard, T.J., Iseli, C., Jean, G., Kahles, A., Lagarde, J., Leng, J., Lefebvre, G., Lewis, S., Mortazavi, A., Niermann, P., Rätsch, G., Reymond, A., Ribeca, P., Richard, H., Rougemont, J., Rozowsky, J., Sammeth, M., Sboner, A., Schulz, M.H., Searle, S.M., Solorzano, N.D., Solovyev, V., Stanke, M., Stevenson, B.J., Stockinger, H., Valsesia, A., Weese, D., White, S., Wold, B.J., Wu, J., Wu, T.D., Zeller, G., Zerbino, D., Zhang, M.Q.

Publikováno v: Nature Methods, vol. 10, no. 12, pp. 1177-1184
Nature methods, vol 10, iss 12
Nature Methods
Nature Methods, Nature Publishing Group, 2013, 10 (12), pp.1177-1184. ⟨10.1038/nmeth.2714⟩
Steijger, T; Abril, JF; Engström, PG; Kokocinski, F; Akerman, M; Alioto, T; et al.(2013). Assessment of transcript reconstruction methods for RNA-seq. Nature Methods, 10(12), 1177-1184. doi: 10.1038/nmeth.2714. UC Berkeley: Retrieved from: http://www.escholarship.org/uc/item/7z46z3k7
Nature Methods, Nature Publishing Group, 2013, 10 (12), pp.1177-1184. 〈10.1038/nmeth.2714〉
Nature Methods, 2013, 10 (12), pp.1177-1184. ⟨10.1038/nmeth.2714⟩
Recercat. Dipósit de la Recerca de Catalunya
instname
Europe PubMed Central
Nature Methods, Vol. 10, No 12 (2013) pp. 1177-84

We evaluated 25 protocol variants of 14 independent computational methods for exon identification, transcript reconstruction and expression-level quantification from RNA-seq data. Our results show that most algorithms are able to identify discrete tr

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::dd88887c042781ec2035c82a3feee85f
https://serval.unil.ch/notice/serval:BIB_63C268AABFEF

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.