The Transcriptional Landscape of the Mammalian Genome

Autor: Carninci, P., Kasukawa, T., Katayama, S., Gough, J., Frith, M. C., Maeda, N., Oyama, R., Ravasi, T., Lenhard, B., Wells, C., Kodzius, R., Shimokawa, K., Bajic, V. B., Brenner, S. E., Batalov, S., Forrest, A. R. R., Zavolan, M., Davis, M. J., Wilming, L. G., Aidinis, V., Allen, J. E., Ambesi-Impiombato, A., Apweiler, R., Aturaliya, R. N., Bailey, T. L., Bansal, M., Baxter, L., Beisel, K. W., Bersano, T., Bono, H., Chalk, A. M., Chiu, K. P., Choudhary, V., Christoffels, A., Clutterbuck, D. R., Crowe, M. L., Dalla, E., Dalrymple, B. P., de Bono, B., Della Gatta, G., di Bernardo, D., Down, T., Engstrom, P., Fagiolini, M., Faulkner, G., Fletcher, C. F., Fukushima, T., Furuno, M., Futaki, S., Gariboldi, M., Georgii-Hemming, P., Gingeras, T. R., Gojobori, T., Green, R. E., Gustincich, S., Harbers, M., Hayashi, Y., Hensch, T. K., Hirokawa, N., Hill, D., Huminiecki, L., Iacono, M., Ikeo, K., Iwama, A., Ishikawa, T., Jakt, M., Kanapin, A., Katoh, M., Kawasawa, Y., Kelso, J., Kitamura, H., Kitano, H., Kollias, G., Krishnan, S. P. T., Kruger, A., Kummerfeld, S. K., Kurochkin, I. V., Lareau, L. F., Lazarevic, D., Lipovich, L., Liu, J., Liuni, S., McWilliam, S., Babu, M. Madan, Madera, M., Marchionni, L., Matsuda, H., Matsuzawa, S., Miki, H., Mignone, F., Miyake, S., Morris, K., Mottagui-Tabar, S., Mulder, N., Nakano, N., Nakauchi, H., Ng, P., Nilsson, R., Nishiguchi, S., Nishikawa, S., Nori, F., Ohara, O., Okazaki, Y., Orlando, V., Pang, K. C., Pavan, W. J., Pavesi, G., Pesole, G., Petrovsky, N., Piazza, S., Reed, J., Reid, J. F., Ring, B. Z., Ringwald, M., Rost, B., Ruan, Y., Salzberg, S. L., Sandelin, A., Schneider, C., Schöbach, C., Sekiguchi, K., Semple, C. A. M., Seno, S., Sessa, L., Sheng, Y., Shibata, Y., Shimada, H., Shimada, K., Silva, D., Sinclair, B., Sperling, S., Stupka, E., Sugiura, K., Sultana, R., Takenaka, Y., Taki, K., Tammoja, K., Tan, S. L., Tang, S., Taylor, M. S., Tegner, J., Teichmann, S. A., Ueda, H. R., van Nimwegen, E., Verardo, R., Wei, C. L., Yagi, K., Yamanishi, H., Zabarovsky, E., Zhu, S., Zimmer, A., Hide, W., Bult, C., Grimmond, S. M., Teasdale, R. D., Liu, E. T., Brusic, V., Quackenbush, J., Wahlestedt, C., Mattick, J. S., Hume, D. A., Kai, C., Sasaki, D., Tomaru, Y., Fukuda, S., Kanamori-Katayama, M., Suzuki, M., Aoki, J., Arakawa, T., Iida, J., Imamura, K., Itoh, M., Kato, T., Kawaji, H., Kawagashira, N., Kawashima, T., Kojima, M., Kondo, S., Konno, H., Nakano, K., Ninomiya, N., Nishio, T., Okada, M., Plessy, C., Shibata, K., Shiraki, T., Suzuki, S., Tagami, M., Waki, K., Watahiki, A., Okamura-Oho, Y., Suzuki, H., Kawai, J.

Publikováno v: Science, 2005 Sep 01. 309(5740), 1559-1563.

Externí odkaz: https://www.jstor.org/stable/3843883

Genome sequence of Chlamydophila caviae (Chlamydia psittaci GPIC): examining the role of niche‐specific genes in the evolution of the Chlamydiaceae.

Autor: Read, T. D., Myers, G. S. A., Brunham, R. C., Nelson, W. C., Paulsen, I. T., Heidelberg, J., Holtzapple, E., Khouri, H., Federova, N. B., Carty, H. A., Umayam, L. A., Haft, D. H., Peterson, J., Beanan, M. J., White, O., Salzberg, S. L., Hsia, R. ‐c., McClarty, G., Rank, R. G., Bavoil, P. M.

Publikováno v: Nucleic Acids Research; Apr2003, Vol. 31 Issue 8, p2134-2147, 14p

A probabilistic method for identifying start codons in bacterial genomes.

Autor: Suzek, B E, Ermolaeva, M D, Schreiber, M, Salzberg, S L

Publikováno v: Bioinformatics; December 2001, Vol. 17 Issue: 12 p1123-1130, 8p

Rice bioinformatics. analysis of rice sequence data and leveraging the data to other plant species.

Autor: Yuan, Q, Quackenbush, J, Sultana, R, Pertea, M, Salzberg, S L, Buell, C R

Publikováno v: Plant Physiology; March 2001, Vol. 125 Issue: 3 p1166-1174, 9p

Prediction of operons in microbial genomes.

Autor: Ermolaeva, M D, White, O, Salzberg, S L

Publikováno v: Nucleic Acids Research; March 2001, Vol. 29 Issue: 5 p1216-1221, 6p