Augmented Sparse Reconstruction of Protein Signaling Networks

Autor: Napoletani, D., Sauer, T., Struppa, D. C., Petricoin, E., Liotta, L.

Publikováno v: Journal of Theoretical Biology, vol. 255, Issue 1, 40-52 (2008)

The problem of reconstructing and identifying intracellular protein signaling and biochemical networks is of critical importance in biology today. We sought to develop a mathematical approach to this problem using, as a test case, one of the most wel

Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/0705.3989

Delay-Coordinates Embeddings as a Data Mining Tool for Denoising Speech Signals

Autor: Napoletani, D., Berenstein, C. A., Sauer, T., Struppa, D. C., Walnut, D.

Publikováno v: Chaos 16, 043116 (2006)

In this paper we utilize techniques from the theory of non-linear dynamical systems to define a notion of embedding threshold estimators. More specifically we use delay-coordinates embeddings of sets of coefficients of the measured signal (in some ch

Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/physics/0504155

Multicanonical multigrid Monte Carlo method and effective autocorellation time

Autor: Janke, W., Sauer, T.

Publikováno v: Nucl.Phys.Proc.Suppl. 34 (1994) 771-773

We report tests of the recently proposed multicanonical multigrid Monte Carlo method for the two-dimensional $\Phi^4$ field theory. Defining an effective autocorrelation time we obtain real time improvement factors of about one order of magnitude com

Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/hep-lat/9312043

Estimated GFR and the Effect of Intensive Blood Pressure Lowering After Acute Intracerebral Hemorrhage

Autor: Anderson, C.S., Chalmers, J., Arima, H., Davis, S., Heeley, E., Huang, Y., Lavados, P., Neal, B., Parsons, M.W., Lindley, R., Morgenstern, L., Robinson, T., Stapf, C., Tzourio, C., Wang, J.G., Chen, S., Chen, X.Y., Cui, L., Liu, Z., Lu, C., Wang, J., Wu, S., Xu, E., Yang, Q., Zhang, C., Zhang, J., Beer, R., Schmutzhard, E., Redondo, P., Kaste, M., Soinne, L., Tatlisumak, T., Wartenberg, K., Ricci, S., Klijn, K., Azevedo, E., Chamorro, A., Arnold, M., Fischer, U., Kaul, S., Pandian, J., Boyini, H., Singh, S., Rabinstein, A.A., Estol, C., Silva, G., Olavarria, V.V., Robinson, T.G., Simes, R.J., Bousser, M.-G., Hankey, G., Jamrozik, K., Johnston, S.C., Li, S., Bailey, K., Cheung, T., Delcourt, C., Chintapatla, S., Ducasse, E., Erho, T., Hata, J., Holder, B., Knight, E., Leroux, M., Sassé, T., Odgers, E., Walsh, R., Wolfowicz, Z., Chen, G., Fuentes, S., Peng, B., Schneble, H.-M., Wang, M.-X., Billot, L., Heritier, S., Li, Q., Woodward, M., Abimbola, S., Anderson, S., Chan, E., 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L., Tian, X., Wang, X., Li, X., Hao, L., Duan, Y., Wang, R., Wei, Z., Ren, S., Ren, H., Dong, Y., Cheng, Y., Liu, W., Han, J., Zhang, Z., Zhu, J., Qian, J., Sun, Y., Liu, K., Long, F., Peng, X., Zhang, Q., Yuan, Z., Wang, C., Huang, M., He, P., You, Y., Xia, J., Zhou, L., Hou, Y., Qi, Y., Mei, L., Lu, R., Ping, L., Zhou, S., Zhang, S., Zou, R., Guo, J., Li, M., Wei, W., Curtze, S., Saarela, M., Strbian, D., Scheperjans, F., De Broucker, T., Henry, C., Cumurciuc, R., Ibos-Augé, N., Zéghoudi, A.-C., Pico, F., Dereeper, O., Simian, M.-C., Boisselier, C., Mahfoud, A., Timsit, S., Merrien, F.M., Guillon, B., Sevin, M., Herisson, F., Magne, C., Ameri, A., Cret, C., Stefanizzi, S., Klapzcynski, F., Denier, C., Sarov-Riviere, M., Reiner, P., Mawet, J., Hervé, D., Buffon, F., Touzé, E., Domigo, V., Lamy, C., Calvet, D., Pasquini, M., Alamowitch, S., Favrole, P., Muresan, I.-P., Crozier, S., Rosso, C., Pires, C., Leger, A., Deltour, S., Cordonnier, C., Henon, H., Rossi, C., Zuber, M., Bruandet, M., Tamazyan, R., Join-Lambert, C., Juettler, E., Krause, T., Maul, S., Endres, M., Jungehulsing, G.J., Hennerici, M., Griebe, M., Sauer, T., Knoll, K., Huber, R., Knauer, K., Knauer, C., Raubold, S., Schneider, H., Hentschel, H., Lautenschläger, C., Schimmel, E., Dzialowski, I., Foerch, C., Lorenz, M., Singer, O., Meyer dos Santos, I.M.R., Hartmann, A., Hamann, A., Schacht, A., Schrader, B., Teíchmann, A., Wartenberg, K.E., Mueller, T.J., Jander, S., Gliem, M., Boettcher, C., Rosenkranz, M., Beck, C., Otto, D., Thomalla, G., Cheng, B., Wong, K.S., Leung, T.W., Soo, Y.O.Y., Prabhakar, S., Kesavarapu, S.R., Gajjela, P.K., Chenna, R.R., Ummer, K., Basheer, M., Andipet, A., Jagarlapudi, M.K.M., Mohammed, A.U.R., Pawar, V.G., Eranki, S.S.K., Singh, Y., Akhtar, N., Borah, N.C., Ghose, M., Choudhury, N., Ichaporia, N.R., Shendge, J., Khese, S., Pamidimukkala, V., Inbamuthaiah, P., Nuthakki, S.R., Tagallamudi, N.M.R., Gutti, A.K., Khurana, D., Kesavarapu, P., Jogi, V., Garg, A., Samanta, D., Sarma, G.R.K., Nadig, R., Mathew, T., Anandan, M.A., Caterbi, E., Zini, A., Cavazzuti, M., Casoni, F., Pentore, R., Falzone, F., Mazzoli, T., Greco, L.M., Menichetti, C., Coppola, F., Cenciarelli, S., Gallinella, E., Mattioni, A., Condurso, R., Sicilia, I., Zampolini, M., Corea, F., Barbi, M., Proietti, C., Toni, D., Pieroni, A., Anzini, A., Falcou, A., Demichele, M., Klijn, C.J.M., Tveiten, A., Thortveit, E.T., Pettersen, S., Holand, N., Hitland, B., Johnsen, S.H., Eltoft, A., Wasay, M., Kamal, A., Iqrar, A., Ali, L., Begum, D., Gama, G., Fonseca, L., Moreira, G., Veloso, L.M., Pinheiro, D., Paredes, L., Rozeira, C., Gregorio, T., Segura Martin, T., Ayo, O., Garcia-Garcia, J., Feria Vilar, I., Gómez Fernández, I., Amaro, S., Urra, X., Obach, V., Cervera, A., Silva, Y., Serena, J., Castellanos, M., Terceno, M., Van Eendenburg, C., Weck, A., Findling, O., Lüdi, R., Warburton, E.A., Day, D., Butler, N., Bumanlag, E., Caine, S., Steele, A., Osborn, M., Dodd, E., Murphy, P., Esisi, B., Brown, E., Hayman, R., Baliga, V.K.V., Minphone, M., Kennedy, J., Reckless, I., Pope, G., Teal, R., Michael, K., Manawadu, D., Kalra, L., Lewis, R., Mistry, B., Cattermole, E., Hassan, A., Mandizvidza, L., Bamford, J., Brooks, H., Bedford, C., Whiting, R., Baines, P., Hussain, M., Harvey, M., Fotherby, K., McBride, S., Bourke, P., Morgan, D., Jennings-Preece, K., Price, C., Huntley, S., Riddell, V.E., Storey, G., Lakey, R.L., Subramanian, G., Jenkinson, D., Kwan, J., David, O., Tiwari, D., James, M., Keenan, S., Eastwood, H., Shaw, L., Kaye, P., Button, D., Madigan, B., Williamson, D., Dixit, A., Davis, J., Hossain, M.O., Ford, G.A., Parry-Jones, A., O'Loughlin, V., Jarapa, R., Naing, Z., Lovelock, C., O'Reilly, J., Khan, U., Bhalla, A., Rudd, A., Birns, J., Werring, D.J., Law, R., Perry, R., Jones, I., Erande, R., Roffe, C., Natarajan, I., Ahmad, N., Finney, K., Lucas, J., Mistri, A., Eveson, D., Marsh, R., Haunton, V., Fugate, J.E., Lepore, S.W., Zheng, Danni, Sato, Shoichiro, Arima, Hisatomi, Heeley, Emma, Delcourt, Candice, Cao, Yongjun, Chalmers, John, Anderson, Craig S.

Publikováno v: In American Journal of Kidney Diseases July 2016 68(1):94-102

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