Machine learning optimization of candidate antibody yields highly diverse sub-nanomolar affinity antibody libraries

Autor: Lin Li, Esther Gupta, John Spaeth, Leslie Shing, Rafael Jaimes, Emily Engelhart, Randolph Lopez, Rajmonda S. Caceres, Tristan Bepler, Matthew E. Walsh

Publikováno v: Nature Communications, Vol 14, Iss 1, Pp 1-12 (2023)

Abstract Therapeutic antibodies are an important and rapidly growing drug modality. However, the design and discovery of early-stage antibody therapeutics remain a time and cost-intensive endeavor. Here we present an end-to-end Bayesian, language mod

Externí odkaz: https://doaj.org/article/4b310d77320b4b48bba9cd5498b95743

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Artificial intelligence for synthetic biology

Autor: Mohammed Eslami, Aaron Adler, Rajmonda S. Caceres, Joshua G. Dunn, Nancy Kelley-Loughnane, Vanessa A. Varaljay, Hector Garcia Martin

Publikováno v: Communications of the ACM. 65:88-97

The opportunities and challenges of adapting and applying AI principles to synbio.

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::1b6aa4ea413d84515cf816987c0fd4da
https://doi.org/10.1145/3500922

The influence of anastomotic techniques on postoperative anastomotic complications: Results of the Oesophago-Gastric Anastomosis Audit

Autor: S.K. Kamarajah, R.P.T. Evans, D. Nepogodiev, J. Hodson, J.R. Bundred, I. Gockel, J.A. Gossage, A. Isik, B. Kidane, H.A. Mahendran, I. Negoi, K.E. Okonta, R. Sayyed, R. van Hillegersberg, R.S. Vohra, B.P.L. Wijnhoven, P. Singh, E.A. Griffiths, D. Alderson, J. Bundred, J. Gossage, B. Jefferies, S. McKay, I. Mohamed, K. Siaw-Acheampong, R. Vohra, K. Wanigasooriya, T. Whitehouse, A. Gjata, J.I. Moreno, F.R. Takeda, R. Guevara Castro, T. Harustiak, A. Bekele, A. Kechagias, A. Kennedy, A. Da Roit, A. Bagajevas, J.S. Azagra, L. Mejía-Fernández, J. El Kafsi, R.H. Sayyed, M. Sousa, A.S. Sampaio, R. Blanco, B. Wallner, P.M. Schneider, P.K. Hsu, S. Gananadha, V. Wills, M. Devadas, C. Duong, M. Talbot, M.W. Hii, R. Jacobs, N.A. Andreollo, B. Johnston, G. Darling, A. Isaza-Restrepo, G. Rosero, F. Arias-Amézquita, D. Raptis, J. Gaedcke, D. Reim, J. Izbicki, J.H. Egberts, S. Dikinis, D.W. Kjaer, M.H. Larsen, M.P. Achiam, J. Saarnio, D. Theodorou, T. Liakakos, D.P. Korkolis, W.B. Robb, C. Collins, T. Murphy, J. Reynolds, V. Tonini, M. Migliore, L. Bonavina, M. Valmasoni, R. Bardini, J. Weindelmayer, M. Terashima, R.E. White, E. Alghunaim, M. Elhadi, A.M. Leon-Takahashi, H. Medina-Franco, P.C. Lau, J. Heisterkamp, C. Rosman, G. Beban, R. Babor, A. Gordon, J.I. Rossaak, K.M.I. Pal, A.U. Qureshi, S.A. Naqi, A.A. Syed, J. Barbosa, C.S. Vicente, J. Leite, J. Freire, R. Casaca, R.C.T. Costa, R.R. Scurtu, S.S. Mogoanta, C. Bolca, S. Constantinoiu, D. Sekhniaidze, M. Bjelović, J.B.Y. So, G. Gačevski, C. Loureiro, M. Pera, A. Bianchi, M. Moreno Gijón, J. Martín Fernández, M.S. Trugeda Carrera, M. Vallve-Bernal, M.A. Cítores Pascual, S. Elmahi, I. Halldestam, J. Hedberg, S. Mönig, S. Gutknecht, M. Tez, A. Guner, M.B. Tirnaksiz, E. Colak, B. Sevinç, A. Hindmarsh, I. Khan, D. Khoo, R. Byrom, J. Gokhale, P. Wilkerson, P. Jain, D. Chan, K. Robertson, S. Iftikhar, R. Skipworth, M. Forshaw, S. Higgs, R. Nijjar, Y.K.S. Viswanath, P. Turner, S. Dexter, A. Boddy, W.H. Allum, S. Oglesby, E. Cheong, D. Beardsmore, N. Maynard, R. Berrisford, S. Mercer, S. Puig, R. Melhado, C. Kelty, T. Underwood, K. Dawas, W. Lewis, A. Al-Bahrani, G. Bryce, M. Thomas, A.T. Arndt, F. Palazzo, R.A. Meguid, J. Fergusson, E. Beenen, C. Mosse, J. Salim, S. Cheah, T. Wright, M.P. Cerdeira, P. McQuillan, M. Richardson, H. Liem, J. Spillane, M. Yacob, F. Albadawi, T. Thorpe, A. Dingle, C. Cabalag, K. Loi, O.M. Fisher, S. Ward, M. Read, M. Johnson, R. Bassari, H. Bui, I. Cecconello, R.A.A. Sallum, J.R.M. da Rocha, L.R. Lopes, V. Tercioti, J.D.S. Coelho, J.A.P. Ferrer, G. Buduhan, L. Tan, S. Srinathan, P. Shea, J. Yeung, F. Allison, P. Carroll, F. Vargas-Barato, F. Gonzalez, J. Ortega, L. Nino-Torres, T.C. Beltrán-García, L. Castilla, M. Pineda, A. Bastidas, J. Gómez-Mayorga, N. Cortés, C. Cetares, S. Caceres, S. Duarte, A. Pazdro, M. Snajdauf, H. Faltova, M. Sevcikova, P.B. Mortensen, N. Katballe, T. Ingemann, B. Morten, I. Kruhlikava, A.P. Ainswort, N.M. Stilling, J. Eckardt, J. Holm, M. Thorsteinsson, M. Siemsen, B. Brandt, B. Nega, E. Teferra, A. Tizazu, J.H. Kauppila, V. Koivukangas, S. Meriläinen, R. Gruetzmann, C. Krautz, G. Weber, H. Golcher, G. Emons, A. Azizian, M. Ebeling, S. Niebisch, N. Kreuser, G. Albanese, J. Hesse, L. Volovnik, U. Boecher, M. Reeh, S. Triantafyllou, D. Schizas, A. Michalinos, E. Balli, M. Mpoura, A. Charalabopoulos, D.K. Manatakis, D. Balalis, J. Bolger, C. Baban, A. Mastrosimone, O. McAnena, A. Quinn, C.B. Ó Súilleabháin, M.M. Hennessy, I. Ivanovski, H. Khizer, N. Ravi, N. Donlon, M. Cervellera, S. Vaccari, S. Bianchini, l. Sartarelli, E. Asti, D. Bernardi, S. Merigliano, L. Provenzano, M. Scarpa, L. Saadeh, B. Salmaso, G. De Manzoni, S. Giacopuzzi, R. La Mendola, C.A. De Pasqual, Y. Tsubosa, M. Niihara, T. Irino, R. Makuuchi, K. Ishii, M. Mwachiro, A. Fekadu, A. Odera, E. Mwachiro, D. AlShehab, H.A. Ahmed, A.O. Shebani, A. Elhadi, F.A. Elnagar, H.F. Elnagar, S.T. Makkai-Popa, L.F. Wong, Y.R. Tan, S. Thannimalai, C.A. Ho, W.S. Pang, J.H. Tan, H.N.L. Basave, R. Cortés-González, S.M. Lagarde, J.J.B. van Lanschot, C. Cords, W.A. Jansen, I. Martijnse, R. Matthijsen, S. Bouwense, B. Klarenbeek, M. Verstegen, F. van Workum, J.P. Ruurda, P.C. van der Sluis, M. de Maat, N. Evenett, P. Johnston, R. Patel, A. MacCormick, M. Young, B. Smith, C. Ekwunife, A.H. Memon, K. Shaikh, A. Wajid, N. Khalil, M. Haris, Z.U. Mirza, S.B.A. Qudus, M.Z. Sarwar, A. Shehzadi, A. Raza, M.H. Jhanzaib, J. Farmanali, Z. Zakir, O. Shakeel, I. Nasir, S. Khattak, M. Baig, Noor MA, H.H. Ahmed, A. Naeem, A.C. Pinho, R. da Silva, A. Bernardes, J.C. Campos, H. Matos, T. Braga, C. Monteiro, P. Ramos, F. Cabral, M.P. Gomes, P.C. Martins, A.M. Correia, J.F. Videira, C. Ciuce, R. Drasovean, R. Apostu, S. Paitici, A.E. Racu, C.V. Obleaga, M. Beuran, B. Stoica, C. Ciubotaru, V. Negoita, I. Cordos, R.D. Birla, D. Predescu, P.A. Hoara, R. Tomsa, V. Shneider, M. Agasiev, I. Ganjara, D. Gunjić, M. Veselinović, T. Babič, T.S. Chin, A. Shabbir, G. Kim, A. Crnjac, H. Samo, I. Díez del Val, S. Leturio, J.M. Ramón, M. Dal Cero, S. Rifá, M. Rico, A. Pagan Pomar, J.A. Martinez Corcoles, J.L. Rodicio Miravalles, S.A. Pais, S.A. Turienzo, L.S. Alvarez, P.V. Campos, A.G. Rendo, S.S. García, E.P.G. Santos, E.T. Martínez, M.J. Fernández Díaz, C. Magadán Álvarez, V. Concepción Martín, C. Díaz López, A. Rosat Rodrigo, L.E. Pérez Sánchez, M. Bailón Cuadrado, C. Tinoco Carrasco, E. Choolani Bhojwani, D.P. Sánchez, M.E. Ahmed, T. Dzhendov, F. Lindberg, M. Rutegård, M. Sundbom, C. Mickael, N. Colucci, A. Schnider, S. Er, E. Kurnaz, S. Turkyilmaz, A. Turkyilmaz, R. Yildirim, B.E. Baki, N. Akkapulu, O. Karahan, N. Damburaci, R. Hardwick, P. Safranek, V. Sujendran, J. Bennett, Z. Afzal, M. Shrotri, B. Chan, K. Exarchou, T. Gilbert, T. Amalesh, D. Mukherjee, S. Mukherjee, T.H. Wiggins, R. Kennedy, S. McCain, A. Harris, G. Dobson, N. Davies, I. Wilson, D. Mayo, D. Bennett, R. Young, P. Manby, N. Blencowe, M. Schiller, B. Byrne, D. Mitton, V. Wong, A. Elshaer, M. Cowen, V. Menon, L.C. Tan, E. McLaughlin, R. Koshy, C. Sharp, H. Brewer, N. Das, M. Cox, W. Al Khyatt, D. Worku, R. Iqbal, L. Walls, R. McGregor, G. Fullarton, A. Macdonald, C. MacKay, C. Craig, S. Dwerryhouse, S. Hornby, S. Jaunoo, M. Wadley, C. Baker, M. Saad, M. Kelly, A. Davies, F. Di Maggio, P. Mistry, R. Singhal, O. Tucker, S. Kapoulas, S. Powell-Brett, P. Davis, G. Bromley, L. Watson, R. Verma, J. Ward, V. Shetty, C. Ball, K. Pursnani, A. Sarela, H. Sue Ling, S. Mehta, J. Hayden, N. To, T. Palser, D. Hunter, K. Supramaniam, Z. Butt, A. Ahmed, S. Kumar, A. Chaudry, O. Moussa, A. Kordzadeh, B. Lorenzi, M. Wilson, P. Patil, I. Noaman, J. Willem, G. Bouras, R. Evans, M. Singh, H. Warrilow, A. Ahmad, N. Tewari, F. Yanni, J. Couch, E. Theophilidou, J.J. Reilly, null van Boxel Gijs, K. Akbari, D. Zanotti, B. Sgromo, G. Sanders, T. Wheatley, A. Ariyarathenam, A. Reece-Smith, L. Humphreys, C. Choh, N. Carter, B. Knight, P. Pucher, A. Athanasiou, B. Tan, M. Abdulrahman, J. Vickers, K. Akhtar, R. Chaparala, R. Brown, M.M.A. Alasmar, R. Ackroyd, K. Patel, A. Tamhankar, A. Wyman, R. Walker, B. Grace, N. Abbassi, N. Slim, L. Ioannidi, G. Blackshaw, T. Havard, X. Escofet, A. Powell, A. Owera, F. Rashid, P. Jambulingam, J. Padickakudi, H. Ben-Younes, K. Mccormack, I.A. Makey, M.K. Karush, C.W. Seder, M.J. Liptay, G. Chmielewski, E.L. Rosato, A.C. Berger, R. Zheng, E. Okolo, A. Singh, C.D. Scott, M.J. Weyant, J.D. Mitchell

Publikováno v: Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 164(3), 674-684.e5. Mosby Inc.
Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 164, 3, pp. 674-684.e5
Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, 164, 674-684.e5
Oesophago-Gastric Anastomosis Audit study group on behalf of the West Midlands Research Collaborative 2022, ' The influence of anastomotic techniques on postoperative anastomotic complications : Results of the Oesophago-Gastric Anastomosis Audit ', The Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery, vol. 164, no. 3, pp. 674-684.e5 . https://doi.org/10.1016/j.jtcvs.2022.01.033

BACKGROUND: The optimal anastomotic techniques in esophagectomy to minimize rates of anastomotic leakage and conduit necrosis are not known. The aim of this study was to assess whether the anastomotic technique was associated with anastomotic failure

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::6e0635766fbaaad10677c40cd8b8ed3e
https://pure.eur.nl/en/publications/fe2516d9-6018-464f-a149-f95980377532