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SARS-CoV-2 BW lineage, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations.

Autor: García-López R; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico. rodrigo.garcia@ibt.unam.mx., Rivera-Gutiérrez X; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Rosales-Rivera M; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Zárate S; Posgrado en Ciencias Genómicas, Universidad Autónoma de la Ciudad de México, Mexico City, Mexico., Muñoz-Medina JE; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico., Roche B; MIVEGEC, Université de Montpellier, IRD, CNRS, Montpellier, France.; Departamento de Etología, Fauna Silvestre y Animales de Laboratorio, Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico., Herrera-Estrella A; Laboratorio Nacional de Genómica Para La Biodiversidad-Unidad de Genómica Avanzada, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Irapuato, Mexico., Gómez-Gil B; Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo AC, Unidad Mazatlán, Mazatlán, Mexico., Sanchez-Flores A; Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y Bioinformática, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Taboada B; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico. blanca.taboada@ibt.unam.mx., Arias CF; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.

Publikováno v: Infection [Infection] 2023 Oct; Vol. 51 (5), pp. 1549-1555. Date of Electronic Publication: 2023 Apr 14.

Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants.

Autor: Zárate S; Posgrado en Ciencias Genómicas, Universidad Autónoma de la Ciudad de México, Mexico City 03100, Mexico., Taboada B; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Rosales-Rivera M; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., García-López R; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Muñoz-Medina JE; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City 07760, Mexico., Sanchez-Flores A; Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y Bioinformática, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Herrera-Estrella A; Laboratorio Nacional de Genómica Para la Biodiversidad-Unidad de Genómica Avanzada, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Irapuato 36821, Mexico., Gómez-Gil B; Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo AC, Coordinación Regional Mazatlán, Acuicultura y Manejo Ambiental, Mazatlan 82100, Mexico., Selem Mojica N; Centro de Ciencias Matemáticas, Universidad Nacional Autónoma de México, Morelia 58089, Mexico., Salas-Lais AG; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City 07760, Mexico., Vazquez-Perez JA; Departamento de Investigación en Tabaquismo y EPOC, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas, México City 14080, Mexico., Cabrera-Gaytán DA; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City 07760, Mexico., Fernandes-Matano L; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City 07760, Mexico., Uribe-Noguez LA; Laboratorio Central de Epidemiología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, 02990, Mexico., Chale-Dzul JB; Unidad de Investigación Médica Yucatán, Instituto Mexicano del Seguro Social, Merida 97150, Mexico., Maldonado Meza BI; Centro de Investigación Biomédica del Noreste, Instituto Mexicano del Seguro Social, Monterrey 64720, Mexico., Mejía-Nepomuceno F; Departamento de Investigación en Tabaquismo y EPOC, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas, México City 14080, Mexico., Pérez-Padilla R; Departamento de Investigación en Tabaquismo y EPOC, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas, México City 14080, Mexico., Gutiérrez-Ríos RM; Departamento de Microbiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Loza A; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Roche B; Infectious Diseases: Vector, Control, Genetic, Ecology and Evolution (MIVEGEC) Université de Montpellier, IRD, CNRS, 34090 Montpellier, France., López S; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico., Arias CF; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca 62210, Mexico.

Publikováno v: Viruses [Viruses] 2023 Jan 15; Vol. 15 (1). Date of Electronic Publication: 2023 Jan 15.

The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico.

Autor: Zárate S; Posgrado en Ciencias Genómicas, Universidad Autónoma de la Ciudad de México, Ciudad de México, México., Taboada B; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Muñoz-Medina JE; Coordinación de Calidad de Insumos y Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México., Iša P; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Sanchez-Flores A; Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y Bioinformática, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Boukadida C; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratoriasgrid.419179.3 Ismael Cosío Villegas, Ciudad de México, México., Herrera-Estrella A; Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad-Unidad de Genómica Avanzada, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Irapuato, México., Selem Mojica N; Centro de Ciencias Matemáticas, Universidad Nacional Autónoma de México, Morelia, México., Rosales-Rivera M; Centro de Investigación en Ciencias, Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Cuernavaca, México., Gómez-Gil B; Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo AC, Unidad Mazatlám, Mazatlán, México., Salas-Lais AG; Laboratorio Central de Epidemiología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México., Santacruz-Tinoco CE; División de Laboratorios Especializados, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México., Montoya-Fuentes H; Centro de Investigación Biomedica de Occidente, Instituto Mexicano del Seguro Social, Guadalajara, México., Alvarado-Yaah JE; Laboratorio Central de Epidemiología, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, México., Molina-Salinas GM; Unidad de Investigación Médica de Yucatán, Instituto Mexicano del Seguro Social, Mérida, México., Espinoza-Ayala GE; Centro de Investigación Biomédica del Noreste, Instituto Mexicano del Seguro Social, Monterrey, México., Enciso-Moreno JA; Unidad de Investigación Biomédica de Zacatecas, Instituto Mexicano del Seguro Social, Zacatecas, Zacatecas, México., Gutiérrez-Ríos RM; Departamento de Microbiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Loza A; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Moreno-Contreras J; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., García-López R; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Rivera-Gutierrez X; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Comas-García A; Facultad de Medicna y Centro de Investigación en Ciencias de la Salud y Biomedicina, Universidad Autónoma de San Luis Potosí, San Luis Potosí, México., Wong-Chew RM; Facultad de Medicina, Laboratorio de Investigación en Enfermedades Infecciosas, División de Investigación, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México., Jiménez-Corona ME; Departamento de Epidemiología Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, México., Del Angel RM; Departamento de Infectómica y Patogénesis Molecular, Cinvestav, Ciudad de México, México., Vazquez-Perez JA; Laboratorio de Biología Molecular de Enfermedades Emergentes y EPOC Instituto Nacional de Enfermedades Respiratoriasgrid.419179.3 Ismael Cosío Villegas, Ciudad de México, México., Matías-Florentino M; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratoriasgrid.419179.3 Ismael Cosío Villegas, Ciudad de México, México., Pérez-García M; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratoriasgrid.419179.3 Ismael Cosío Villegas, Ciudad de México, México., Ávila-Ríos S; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratoriasgrid.419179.3 Ismael Cosío Villegas, Ciudad de México, México., Castelán-Sánchez HG; Programa de Investigadoras e investigadores por México Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, Ciudad de México, México., Delaye L; Departamento de Ingeniería Genética, Cinvestav Unidad Irapuato, Guanajuato, México., Martínez-Castilla LP; Programa de Investigadoras e investigadores por México Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, Ciudad de México, México.; Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Cuajimalpa, Ciudad de México, México., Escalera-Zamudio M; Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, United Kingdom., López S; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México., Arias CF; Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, México.

Publikováno v: Microbiology spectrum [Microbiol Spectr] 2022 Apr 27; Vol. 10 (2), pp. e0224021. Date of Electronic Publication: 2022 Apr 07.

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