Human-lineage-specific genomic elements are associated with neurodegenerative disease and APOE transcript usage

Autor: Chen, Z., Zhang, D., Reynolds, R.H., Gustavsson, E.K., García-Ruiz, S., D'Sa, K., Fairbrother-Browne, A., Vandrovcova, J., Noyce, A.J., Kaiyrzhanov, R., Middlehurst, B., Kia, D.A., Tan, M., Morris, H.R., Plun-Favreau, H., Holmans, P., Trabzuni, D., Bras, J., Quinn, J., Mok, K.Y., Kinghorn, K.J., Billingsley, K., Wood, N.W., Lewis, P., Schreglmann, S., Guerreiro, Rita, Lovering, R., R'Bibo, L., Manzoni, C., Rizig, M., Guelfi, S., Escott-Price, V., Chelban, V., Foltynie, T., Williams, N., Brice, A., Danjou, F., Lesage, S., Corvol, Jean-Christophe, Martinez, M., Schulte, C., Brockmann, K., Simón-Sánchez, J., Heutink, P., Rizzu, P., Sharma, M., Gasser, T., Nicolas, A., Cookson, M. R, Bandres-Ciga, S., Blauwendraat, Cornelis, Craig, David W, Faghri, F., Gibbs, J.R., Hernandez, D.G., Van Keuren-Jensen, K., Shulman, J.M., Leonard, H.L., Nalls, M.A., Robak, L., Lubbe, S., Finkbeiner, S., Mencacci, N.E., Lungu, C., Singleton, A. B., Scholz, S.W., Reed, X., Alcalay, Roy N, Gan-Or, Z., Rouleau, G.A., Krohn, L., van Hilten, J.J., Marinus, J., Adarmes-Gómez, A.D, Aguilar Barberà, Miquel, Alvarez, Ignacio, Alvarez, V., Barrero, F. J, Yarza, J.A.B., Bernal-Bernal, I., Blazquez, M., Bonilla-Toribio, Marta, Botía, J., Boungiorno, M.T., Buiza-Rueda, Dolores, Cámara, Ana, Carrillo, F., Carrión-Claro, M., Cerdan, D., Clarimón, Jordi, Compta, Yaroslau, Diez-Fairen, M., Dols Icardo, Oriol, Duarte, J., Duran, Raquel, Escamilla-Sevilla, F., Ezquerra, M., Feliz, C., Fernández, M., Fernández-Santiago, R., Garcia, C., García-Ruiz, P., Gómez-Garre, P., Heredia, M.J.G., Gonzalez-Aramburu, I., Pagola, A.G., Hoenicka, J., Infante, J., Jesús, S., Jimenez-Escrig, A., Kulisevsky, Jaime, Labrador-Espinosa, Miguel A, Lopez-Sendon, J.L., de Munain Arregui, A.L., Macias, D., Torres, I.M., Marín, J., Marti, M.J., Martínez-Castrillo, J.C., Méndez-del-Barrio, C., González, M.M., Mata, M., Mínguez, A., Mir, P., Rezola, E.M., Muñoz, E., Pagonabarraga Mora, Javier, Pastor, P., Errazquin, F.P., Periñán-Tocino, T., Ruiz-Martínez, J., Ruz, C., Rodriguez, A.S., Sierra, M., Suarez-Sanmartin, E., Tabernero, C., Tartari, J. P., Tejera-Parrado, C., Tolosa, E., Valldeoriola, F., Vargas-González, L., Vela, L., Vives, F., Zimprich, Alexander, Pihlstrom, L., Toft, M., Koks, S., Taba, P., Hassin-Baer, S., Hardy, J., Houlden, Henry, Gagliano Taliun, S. A., Ryten, M., Universitat Autònoma de Barcelona

Publikováno v: Nature communications, vol 12, iss 1
Nature Communications 12, 2076 (2021)
Nature Communications, Vol 12, Iss 1, Pp 1-13 (2021)
Nature communications
Nature Communications
Digital.CSIC. Repositorio Institucional del CSIC
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UCrea Repositorio Abierto de la Universidad de Cantabria
Universidad de Cantabria (UC)

Knowledge of genomic features specific to the human lineage may provide insights into brain-related diseases. We leverage high-depth whole genome sequencing data to generate a combined annotation identifying regions simultaneously depleted for geneti

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::8d89fb6c0172da3ad22f71ca50851027
https://ddd.uab.cat/record/272005

Moving beyond neurons: the role of cell type-specific gene regulation in Parkinson's disease heritability

Autor: Reynolds, R.H., Botia, J., Nalls, M.A., Hardy, J., Taliun, S.A.G., Ryten, M., Noyce, A.J., Nicolas, A., Cookson, M.R., Bandres-Ciga, S., Gibbs, J.R., Hernandez, D.G., Singleton, A.B., Reed, X., Leonard, H., Blauwendraat, C., Faghri, F., Bras, J., Guerreiro, R., Tucci, A., Kia, D.A., Houlden, H., Plun-Favreau, H., Mok, K.Y., Wood, N.W., Lovering, R., R'Bibo, L., Rizig, M., Chelban, V., Trabzuni, D., Tan, M., Morris, H.R., Middlehurst, B., Quinn, J., Billingsley, K., Holmans, P., Kinghorn, K.J., Lewis, P., Escott-Price, V., Williams, N., Foltynie, T., Brice, A., Danjou, F., Lesage, S., Corvol, J.C., Martinez, M., Giri, A., Schulte, C., Brockmann, K., Simon-Sanchez, J., Heutink, P., Gasser, T., Rizzu, P., Sharma, M., Shulman, J.M., Robak, L., Lubbe, S., Mencacci, N.E., Finkbeiner, S., Lungu, C., Scholz, S.W., Gan-Or, Z., Rouleau, G.A., Krohan, L., Hilten, J.J. van, Marinus, J., Adarmes-Gomez, A.D., Bernal-Bernal, I., Bonilla-Toribio, M., Buiza-Rueda, D., Carrillo, F., Carrion-Claro, M., Mir, P., Gomez-Garre, P., Jesus, S., Labrador-Espinosa, M.A., Macias, D., Vargas-Gonzalez, L., Mendez-del-Barrio, C., Perinan-Tocino, T., Tejera-Parrado, C., Diez-Fairen, M., Aguilar, M., Alvarez, I., Boungiorno, M.T., Carcel, M., Pastor, P., Tartari, J.P., Alvarez, V., Gonzalez, M.M., Blazquez, M., Garcia, C., Suarez-Sanmartin, E., Barrero, F.J., Rezola, E.M., Yarza, J.A.B., Pagola, A.G., Arregui, A.L.D., Ruiz-Martinez, J., Cerdan, D., Duarte, J., Clarimon, J., Dols-Icardo, O., Infante, J., Marin, J., Kulisevsky, J., Pagonabarraga, J., Gonzalez-Aramburu, I., Rodriguez, A.S., Sierra, M., Duran, R., Ruz, C., Vives, F., Escamilla-Sevilla, F., Minguez, A., Camara, A., Compta, Y., Ezquerra, M., Marti, M.J., Fernandez, M., Munoz, E., Fernandez-Santiago, R., Tolosa, E., Valldeoriola, F., Garcia-Ruiz, P., Heredia, M.J.G., Errazquin, F.P., Hoenicka, J., Jimenez-Escrig, A., Martinez-Castrillo, J.C., Lopez-Sendon, J.L., Torres, I.M., Tabernero, C., Vela, L., Zimprich, A., Pihlstrom, L., Koks, S., Taba, P., Majamaa, K., Siitonen, A., Okubadejo, N.U., Ojo, O.O., Pitcher, T., Anderson, T., Bentley, S., Fowdar, J., Mellick, G., Dalrymple-Alford, J., Henders, A.K., Kassam, I., Montgomery, G., Sidorenko, J., Zhang, F.T., Xue, A.L., Vallerga, C.L., Wallace, L., Wray, N.R., Yang, J., Visscher, P.M., Gratten, J., Silburn, P.A., Halliday, G., Hickie, I., Kwok, J., Lewis, S., Kennedy, M., Pearson, J., Int Parkinsons Dis Genomics, Syst Genomics Parkinsons Dis

Publikováno v: npj Parkinson's Disease, 5

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::15558a829cd2ccd32d8196e2ff7c4991
https://hdl.handle.net/1887/120798

Mitochondria function associated genes contribute to Parkinson’s Disease risk and later age at onset

Autor: Billingsley K.J., Barbosa I.A., Bandrés-Ciga S., Quinn J.P., Bubb V.J., Deshpande C., Botia J.A., Reynolds R.H., Zhang D., Simpson M.A., Blauwendraat C., Gan-Or Z., Gibbs J.R., Nalls M.A., Singleton A., Noyce A., Tucci A., Middlehurst B., Kia D., Tan M., Houlden H., Morris H.R., Plun-Favreau H., Holmans P., Hardy J., Trabzuni D., Bras J., Mok K., Kinghorn K., Wood N., Lewis P., Guerreiro R., Lovering R., R’Bibo L., Rizig M., Escott-Price V., Chelban V., Foltynie T., Williams N., Brice A., Danjou F., Lesage S., Martinez M., Giri A., Schulte C., Brockmann K., Simón-Sánchez J., Heutink P., Rizzu P., Sharma M., Gasser T., Nicolas A., Cookson M., Faghri F., Hernandez D., Shulman J., Robak L., Lubbe S., Finkbeiner S., Mencacci N., Lungu C., Scholz S., Reed X., Leonard H., Rouleau G., Krohan L., van Hilten J., Marinus J., Adarmes-Gómez A., Aguilar M., Alvarez I., Alvarez V., Javier Barrero F., Bergareche Yarza J., Bernal-Bernal I., Blazquez M., Bernal M.B.-T., Boungiorno M., Buiza-Rueda D., Cámara A., Carcel M., Carrillo F., Carrión-Claro M., Cerdan D., Clarimón J., Compta Y., Diez-Fairen M., Dols-Icardo O., Duarte J., Duran R., Escamilla-Sevilla F., Ezquerra M., Fernández M., Fernández-Santiago R., Garcia C., García-Ruiz P., Gómez-Garre P., Heredia M.G., Gonzalez-Aramburu I., Pagola A.G., Hoenicka J., Infante J., Jesús S., Jimenez-Escrig A., Kulisevsky J., Labrador-Espinosa M., Lopez-Sendon J., de Munain Arregui A.L., Macias D., Torres I.M., Marín J., Marti M.J., Martínez-Castrillo J., Méndez-del-Barrio C., Menéndez González M., Mínguez A., Mir P., Rezola E.M., Muñoz E., Pagonabarraga J., Pastor P., Errazquin F.P., Periñán-Tocino T., Ruiz-Martínez J., Ruz C., Rodriguez A.S., Sierra M., Suarez-Sanmartin E., Tabernero C., Tartari J.P., Tejera-Parrado C., Tolosa E., Valldeoriola F., Vargas-González L., Vela L., Vives F., Zimprich A., Pihlstrom L., Taba P., Majamaa K., Siitonen A., Okubadejo N., Ojo O., Ryten M., Koks S.

Publikováno v: npj Parkinsons Disease
r-IIB SANT PAU. Repositorio Institucional de Producción Científica del Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau
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Mitochondrial dysfunction has been implicated in the etiology of monogenic Parkinson’s disease (PD). Yet the role that mitochondrial processes play in the most common form of the disease; sporadic PD, is yet to be fully established. Here, we compre

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