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Genotype-by-sequencing (GBS) is a widely used cost-effective technique to obtain large numbers of genetic markers from populations. Although a standard reference-based pipeline can be followed to analyze these reads, a reference genome is still not a
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https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::d32f6a078e9bbf002517cbe5630324d5
https://doi.org/10.1101/2020.11.28.402131
https://doi.org/10.1101/2020.11.28.402131
Autor:
Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia., Delgadillo-Duran DA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia., Flores-Gonzalez M; Boyce Thompson Institute, Ithaca, NY 14850, USA., Mueller LA; Boyce Thompson Institute, Ithaca, NY 14850, USA., Cristancho MA; Vicerrectoría de Investigación y Creación, Universidad de los Andes, Bogotá 111711, Colombia., Barrero LS; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia.
Publikováno v:
G3 (Bethesda, Md.) [G3 (Bethesda)] 2024 Sep 04; Vol. 14 (9).
Autor:
Manrique-Carpintero NC; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Berdugo-Cely JA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia.; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Turipaná, Montería, Colombia., Cerón-Souza I; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Lasso-Paredes Z; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Yockteng R; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera, Colombia.; Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité-UMR-CNRS 7205, National Museum of Natural History, Paris, France.
Publikováno v:
Frontiers in plant science [Front Plant Sci] 2023 Apr 26; Vol. 14, pp. 1046400. Date of Electronic Publication: 2023 Apr 26 (Print Publication: 2023).
Autor:
Cerón-Souza I; CI Tibaitatá, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, AGROSAVIA, Km 14 via Mosquera, Bogotá, Colombia., Delgadillo-Duran D; CI Tibaitatá, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, AGROSAVIA, Km 14 via Mosquera, Bogotá, Colombia., Polo-Murcia SM; CI Tibaitatá, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, AGROSAVIA, Km 14 via Mosquera, Bogotá, Colombia., Sarmiento-Naizaque ZX; CI Tibaitatá, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, AGROSAVIA, Km 14 via Mosquera, Bogotá, Colombia., Reyes-Herrera PH; CI Tibaitatá, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, AGROSAVIA, Km 14 via Mosquera, Bogotá, Colombia.
Publikováno v:
Biodiversity and conservation [Biodivers Conserv] 2023; Vol. 32 (7), pp. 2221-2261. Date of Electronic Publication: 2023 May 19.
Autor:
Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Torres-Bedoya E; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia.; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Lopez-Alvarez D; Universidad Nacional de Colombia, Sede Palmira, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Ciencias Biológicas, Palmira, Colombia., Burbano-David D; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Carmona SL; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Bebber DP; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Studholme DJ; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Betancourt M; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Soto-Suarez M; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia.
Publikováno v:
Phytopathology [Phytopathology] 2023 Jan; Vol. 113 (1), pp. 90-97. Date of Electronic Publication: 2022 Dec 14.
Autor:
Parra-Salazar A; Department of Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia., Gomez J; Department of Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia., Lozano-Arce D; Department of Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia., Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Colombia., Duitama J; Department of Systems and Computing Engineering, Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia.
Publikováno v:
Molecular ecology resources [Mol Ecol Resour] 2022 Jan; Vol. 22 (1), pp. 439-454. Date of Electronic Publication: 2021 Jul 29.
Autor:
Garreta L; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia., Cerón-Souza I; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia., Palacio MR; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI El Mira Tumaco Colombia., Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia.
Publikováno v:
Ecology and evolution [Ecol Evol] 2021 May 12; Vol. 11 (12), pp. 7411-7426. Date of Electronic Publication: 2021 May 12 (Print Publication: 2021).
Autor:
Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Muñoz-Baena L; Department of Microbiology and Immunology, Western University, London, ON, Canada., Velásquez-Zapata V; Department of Plant Pathology and Microbiology, Interdepartmental Bioinformatics and Computational Biology, Iowa State University, Ames, IA, United States., Patiño L; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Delgado-Paz OA; Facultad de Ingenierías, Universidad Católica de Oriente-UCO, Rionegro, Antioquia., Díaz-Diez CA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Navas-Arboleda AA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Cortés AJ; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia.
Publikováno v:
Frontiers in plant science [Front Plant Sci] 2020 Dec 23; Vol. 11, pp. 555071. Date of Electronic Publication: 2020 Dec 23 (Print Publication: 2020).
Autor:
Reyes-Herrera PH; Colombian Corporation for Agricultural Research (CORPOICA), 250047 Bogotá, Colombia., Speck-Hernandez CA; Universidad Antonio Nariño, 110311 Bogotá, Colombia., Sierra CA; Universidad Antonio Nariño, 110311 Bogotá, Colombia., Herrera S; Woods Hole Oceanographic Institution, 02543 Massachusetts, USA and Massachusetts Institute of Technology, 02139 Massachusetts, USA.
Publikováno v:
Bioinformatics (Oxford, England) [Bioinformatics] 2015 Nov 15; Vol. 31 (22), pp. 3703-5. Date of Electronic Publication: 2015 Jul 29.
Autor:
Herrera S; Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution Biology Department, Massachusetts Institute of Technology sherrera@alum.mit.edu., Reyes-Herrera PH; Colombian Corporation for Agricultural Research (CORPOICA), Bogotá, Colombia., Shank TM; Biology Department, Woods Hole Oceanographic Institution.
Publikováno v:
Genome biology and evolution [Genome Biol Evol] 2015 Nov 03; Vol. 7 (12), pp. 3207-25. Date of Electronic Publication: 2015 Nov 03.