Chromosome-scale genome assembly and annotation of the tetraploid potato cultivar Diacol Capiro adapted to the Andean region.

Autor: Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia., Delgadillo-Duran DA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia., Flores-Gonzalez M; Boyce Thompson Institute, Ithaca, NY 14850, USA., Mueller LA; Boyce Thompson Institute, Ithaca, NY 14850, USA., Cristancho MA; Vicerrectoría de Investigación y Creación, Universidad de los Andes, Bogotá 111711, Colombia., Barrero LS; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Bogotá, Cundinamarca 250047, Colombia.

Publikováno v: G3 (Bethesda, Md.) [G3 (Bethesda)] 2024 Sep 04; Vol. 14 (9).

Robust and efficient software for reference-free genomic diversity analysis of GBS data on diploid and polyploid species

Autor: Lozano-Arce D, Reyes-Herrera Ph, Jorge Duitama, Parra-Salazar A, Jorge M. Gómez

Genotype-by-sequencing (GBS) is a widely used cost-effective technique to obtain large numbers of genetic markers from populations. Although a standard reference-based pipeline can be followed to analyze these reads, a reference genome is still not a

Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::d32f6a078e9bbf002517cbe5630324d5
https://doi.org/10.1101/2020.11.28.402131

Genome Sequence Data Reveal at Least Two Distinct Incursions of the Tropical Race 4 Variant of Fusarium Wilt into South America.

Autor: Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Torres-Bedoya E; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia.; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Lopez-Alvarez D; Universidad Nacional de Colombia, Sede Palmira, Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Ciencias Biológicas, Palmira, Colombia., Burbano-David D; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Carmona SL; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Bebber DP; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Studholme DJ; Biosciences, University of Exeter, Geoffrey Pope Building, Exeter, United Kingdom., Betancourt M; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia., Soto-Suarez M; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-Agrosavia, C.I Tibaitatá, Km 14 vía, Mosquera-Bogotá, Cundinamarca, Colombia.

Publikováno v: Phytopathology [Phytopathology] 2023 Jan; Vol. 113 (1), pp. 90-97. Date of Electronic Publication: 2022 Dec 14.

MultiGWAS: An integrative tool for Genome Wide Association Studies in tetraploid organisms.

Autor: Garreta L; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia., Cerón-Souza I; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia., Palacio MR; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI El Mira Tumaco Colombia., Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) CI Tibaitatá Bogota Colombia.

Publikováno v: Ecology and evolution [Ecol Evol] 2021 May 12; Vol. 11 (12), pp. 7411-7426. Date of Electronic Publication: 2021 May 12 (Print Publication: 2021).

Inheritance of Rootstock Effects in Avocado ( Persea americana Mill.) cv. Hass.

Autor: Reyes-Herrera PH; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI Tibaitatá, Mosquera, Colombia., Muñoz-Baena L; Department of Microbiology and Immunology, Western University, London, ON, Canada., Velásquez-Zapata V; Department of Plant Pathology and Microbiology, Interdepartmental Bioinformatics and Computational Biology, Iowa State University, Ames, IA, United States., Patiño L; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Delgado-Paz OA; Facultad de Ingenierías, Universidad Católica de Oriente-UCO, Rionegro, Antioquia., Díaz-Diez CA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Navas-Arboleda AA; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia., Cortés AJ; Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA)-CI La Selva, Rionegro, Colombia.

Publikováno v: Frontiers in plant science [Front Plant Sci] 2020 Dec 23; Vol. 11, pp. 555071. Date of Electronic Publication: 2020 Dec 23 (Print Publication: 2020).