Zobrazeno 1 - 10
of 50
pro vyhledávání: '"Read classification"'
Publikováno v:
Animal Microbiome, Vol 4, Iss 1, Pp 1-17 (2022)
Abstract Microbiome analysis is quickly moving towards high-throughput methods such as metagenomic sequencing. Accurate taxonomic classification of metagenomic data relies on reference sequence databases, and their associated taxonomy. However, for u
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/017ab3d6a0ae4cb0a15e502f6d4e9d32
Autor:
Laura-Jayne Gardiner, Niina Haiminen, Filippo Utro, Laxmi Parida, Ed Seabolt, Ritesh Krishna, James H. Kaufman
Publikováno v:
Microbiome, Vol 9, Iss 1, Pp 1-12 (2021)
Abstract Background Widespread bioinformatic resource development generates a constantly evolving and abundant landscape of workflows and software. For analysis of the microbiome, workflows typically begin with taxonomic classification of the microor
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/2bf13594dff849329d5943a510142310
Publikováno v:
Biomolecules, Vol 13, Iss 4, p 585 (2023)
Metagenomics is a technique for genome-wide profiling of microbiomes; this technique generates billions of DNA sequences called reads. Given the multiplication of metagenomic projects, computational tools are necessary to enable the efficient and acc
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/6f02c2d5ed674f6ea1ea63577301788b
Publikováno v:
Frontiers in Cell and Developmental Biology, Vol 9 (2021)
There is still a lack of fast and accurate classification tools to identify the taxonomies of noisy long reads, which is a bottleneck to the use of the promising long-read metagenomic sequencing technologies. Herein, we propose de Bruijn graph-based
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/f287b7215b044f9980eb8eb7e9f7ebc7
Publikováno v:
BMC Bioinformatics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-14 (2019)
Abstract Background Strain-level RNA virus characterization is essential for developing prevention and treatment strategies. Viral metagenomic data, which can contain sequences of both known and novel viruses, provide new opportunities for characteri
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/cc3a27397e864c298af5fec5eee54506
Autor:
Tithi, Saima Sultana
Viruses have huge impact on controlling diseases and regulating many key ecosystem processes. As metagenomic data can contain many microbiomes including many viruses, by analyzing metagenomic data we can analyze many viruses at the same time. The fir
Externí odkaz:
http://hdl.handle.net/10919/97194
Autor:
Margherita Cavattoni, Matteo Comin
Publikováno v:
Journal of Computational Biology.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.