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Plongement de graphes multicouches pour l'intégration de données omiques en bioinformatique
Autor: Jagtap, Surabhi
Publikováno v: Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Paris-Saclay, 2023. English. ⟨NNT : 2023UPAST014⟩
Biological systems are composed of interacting bio-molecules at different molecular levels. With the advent of high-throughput technologies, omics data at their respective molecular level can be easily obtained. These huge, complex multi-omics data c
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od_______165::94288a709b8f9def7c9ad91c5cc1e08f
https://theses.hal.science/tel-04073949/file/2023UPAST014_JAGTAP_archivage.pdf
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L'hypophyse dévoilée : du couplage stimulation-sécrétion aux réseaux cellulaires câblant la glande
Autor: Mollard, Patrice
Publikováno v: Biologie Aujourd'hui
Biologie Aujourd'hui, 2023
International audience; Titre court : Réseaux cellulaires intra-hypophysaires et couplage stimulation-sécrétion Reçu le 10 octobre 2022 Résumé-L'année 2021 s'est terminée par un événement de grande tristesse : le décès d'Andrée Tixier-Vi
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______1398::030fc5c929191ffd37154ac3d175932a
https://hal.science/hal-04013916
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MiBiOmics: an interactive web application for multi-omics data exploration and integration
Autor: Jean-Francois Guillaume, Johanna Zoppi, Michel Neunlist, Samuel Chaffron
Publikováno v: BMC Bioinformatics
BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2021, 22 (1), ⟨10.1186/s12859-020-03921-8⟩
BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), ⟨10.1186/s12859-020-03921-8⟩
BMC Bioinformatics, Vol 22, Iss 1, Pp 1-14 (2021)
BackgroundMulti-omics experimental approaches are becoming common practice in biological and medical sciences underlying the need to design new integrative techniques and applications to enable the holistic characterization of biological systems. The
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::edbe6c667665fbe68466149ece1ed86b
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03101013
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Research and development of innovative mathematical algorithms using cluster-based interactions of metagenomic data in biomedicine
Autor: Champion, Camille
Publikováno v: Statistiques [math.ST]. Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse, 2021. Français
The developement of new biotechnologies offers a large variety of biological datasets, extending the scope of biomedical research. These include genomic datasets, highly developed in statistical literature and metagenomic datasets, still relatively u
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______4074::c8e40920d0caca4a45c15f854abf12d0
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03356498
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Modèles computationnels de cellules biologiques pour l'évolution moléculaire et la nutrition
Autor: Knibbe, Carole
Publikováno v: Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, 2021
Ce mémoire présente les approches de modélisation et de simulation que j'ai développées, avec mes étudiantes et mes étudiants, mes collaborateurs et collaboratrices, pour étudier certaines propriétés des cellules vivantes. Il peut s'agit so
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od_______165::bb8125cd5caf219e6871f31c7b36cfd6
https://theses.hal.science/tel-03701421/file/HDR_carole_knibbe.pdf
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6
Computational models of biological cells for molecular evolution and nutrition
Autor: Knibbe, Carole
Publikováno v: Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, 2021
Ce mémoire présente les approches de modélisation et de simulation que j'ai développées, avec mes étudiantes et mes étudiants, mes collaborateurs et collaboratrices, pour étudier certaines propriétés des cellules vivantes. Il peut s'agit so
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______1398::bb8125cd5caf219e6871f31c7b36cfd6
https://theses.hal.science/tel-03701421/file/HDR_carole_knibbe.pdf
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Noeuds pilotes dans les réseaux biologiques
Autor: Bassignana, Giulia
Publikováno v: Mathematics [math]. Sorbonne Universites, UPMC University of Paris 6, 2020. English
Bioinformatics [q-bio.QM]. Sorbonne Université, 2020. English. ⟨NNT : 2020SORUS044⟩
The possibility of using mathematical tools to describe and influence complex interconneced systems is getting more and more attainable. Methods based on network controllability to identify the nodes able to impact the state of a whole system are now
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::062ba0c17660f182317abb6d186c3ba7
https://hal.inria.fr/tel-03022357
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Dissertation/ Thesis
Approaches to explore multiplex biological networks and application to study premature aging diseases
Autor: Valdeolivas Urbelz, Alberto
Les gènes et les protéines n’agissent pas de manière isolée dans les cellules, mais interagissent plutôt pour faire leurs fonctions dans les processus biologiques. Ces interactions peuvent être représentées sous forme de grands réseaux dan
Externí odkaz: http://www.theses.fr/2019AIXM0106
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Méthodes exactes pour la détermination d'un plus long chemin DG-consistant dans des réseaux biologiques
Autor: AHMED SIDI, Mohamed Lemine, Bocquillion, Ronan, Mohamed Babou, Hafedh, Dhib, Cheikh, Farouk Nanne, Mohamedade, Neron, Emmanuel, Soukhal, Ameur
Publikováno v: ROADEF 2019, 20ème congrès annuel de la société Française de Recherche Opérationnelle et d’Aide à la Décision
ROADEF 2019, 20ème congrès annuel de la société Française de Recherche Opérationnelle et d’Aide à la Décision, Feb 2019, Le Havre, France
National audience
Externí odkaz: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::14672217cfbf8cd45812b7114b8565f7
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02400161/document
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Dissertation/ Thesis
Reconstruction et classification par optimisation dans des graphes avec à priori pour les réseaux de gènes et les images
Autor: Pirayre, Aurélie
Dans de nombreuses applications telles que la médecine, l'environnement ou les biotechnologies par exemple, la découverte de nouveau processus de régulations de gènes permet une meilleure compréhension des réponses phénotypiques des cellules
Externí odkaz: http://www.theses.fr/2017PESC1170/document
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