Výsledky vyhledávání - "Protein-ligand interactions"

Report

Natural Language Processing Methods for the Study of Protein-Ligand Interactions

Autor: Michels, James, Bandarupalli, Ramya, Akbari, Amin Ahangar, Le, Thai, Xiao, Hong, Li, Jing, Hom, Erik F. Y.

Recent advances in Natural Language Processing (NLP) have ignited interest in developing effective methods for predicting protein-ligand interactions (PLIs) given their relevance to drug discovery and protein engineering efforts and the ever-growing

Externí odkaz: http://arxiv.org/abs/2409.13057

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

ML-PLIC: a web platform for characterizing protein–ligand interactions and developing machine learning-based scoring functions.

Autor: Zhang, Xujun¹ (AUTHOR), Shen, Chao^1,2 (AUTHOR), Wang, Tianyue¹ (AUTHOR), Deng, Yafeng² (AUTHOR), Kang, Yu¹ (AUTHOR), Li, Dan¹ (AUTHOR), Hou, Tingjun¹ (AUTHOR) tingjunhou@zju.edu.cn, Pan, Peichen¹ (AUTHOR) tingjunhou@zju.edu.cn

Publikováno v: Briefings in Bioinformatics. Sep2023, Vol. 24 Issue 5, p1-11. 11p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

HCovDock: an efficient docking method for modeling covalent protein–ligand interactions.

Autor: Wu, Qilong¹ (AUTHOR), Huang, Sheng-You¹ (AUTHOR) huangsy@hust.edu.cn

Publikováno v: Briefings in Bioinformatics. Jan2023, Vol. 24 Issue 1, p1-12. 12p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Accurate prediction of protein–ligand interactions by combining physical energy functions and graph-neural networks.

Autor: Hong, Yiyu¹ (AUTHOR), Ha, Junsu¹ (AUTHOR), Sim, Jaemin² (AUTHOR), Lim, Chae Jo³ (AUTHOR), Oh, Kwang-Seok³ (AUTHOR), Chandrasekaran, Ramakrishnan¹ (AUTHOR), Kim, Bomin⁴ (AUTHOR), Choi, Jieun⁴ (AUTHOR), Ko, Junsu¹ (AUTHOR) junsuko@arontier.co, Shin, Woong-Hee^1,5 (AUTHOR) whshin@korea.ac.kr, Lee, Juyong^1,2,4,6 (AUTHOR) nicole23@snu.ac.kr

Publikováno v: Journal of Cheminformatics. 11/4/2024, Vol. 16 Issue 1, p1-15. 15p.

Zobrazit plný text záznamu

Plný text ve formátu HTML

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Akademický článek

Gibbs Free Energy and Enthalpy–Entropy Compensation in Protein–Ligand Interactions

Autor: Juan S. Jiménez, María J. Benítez

Publikováno v: Biophysica, Vol 4, Iss 2, Pp 298-309 (2024)

The thermodynamics of protein–ligand interactions seems to be associated with a narrow range of Gibbs free energy. As a consequence, a linear enthalpy–entropy relationship showing an apparent enthalpy–entropy compensation (EEC) is frequently as

Externí odkaz: https://doaj.org/article/43227e40a9c14276a817a66ee4e4576d

Zobrazit plný text záznamu

Akademický článek

Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.

Vyhledávací nástroje:

Upřesnit hledání