Zobrazeno 1 - 10
of 10 728
pro vyhledávání: '"Protein Data Bank"'
Autor:
Filomeno Sánchez Rodríguez, Adam J. Simpkin, Grzegorz Chojnowski, Ronan M. Keegan, Daniel J. Rigden
Publikováno v:
IUCrJ, Vol 11, Iss 6, Pp 938-950 (2024)
The accuracy of the information in the Protein Data Bank (PDB) is of great importance for the myriad downstream applications that make use of protein structural information. Despite best efforts, the occasional introduction of errors is inevitable, e
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/5e6b06cec2dd4c3b99bbba3590a1c3f6
Autor:
Alexander Wlodawer, Zbigniew Dauter, Pawel Rubach, Wladek Minor, Joanna I. Loch, Dariusz Brzezinski, Miroslaw Gilski, Mariusz Jaskolski
Publikováno v:
IUCrJ, Vol 11, Iss 6, Pp 966-976 (2024)
The absence of solvent molecules in high-resolution protein crystal structure models deposited in the Protein Data Bank (PDB) contradicts the fact that, for proteins crystallized from aqueous media, water molecules are always expected to bind to the
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/34e7ad461dbc4d8db9c0437fa3c8e9c6
Publikováno v:
IUCrJ, Vol 11, Iss 3, Pp 279-286 (2024)
The Protein Data Bank (PDB) was established as the first open-access digital data resource in biology and medicine in 1971 with seven X-ray crystal structures of proteins. Today, the PDB houses >210 000 experimentally determined, atomic level, 3D str
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/0cd7c7d944c8444f884de5367ef41ad1
Autor:
Gerard J. Kleywegt, Paul D. Adams, Sarah J. Butcher, Catherine L. Lawson, Alexis Rohou, Peter B. Rosenthal, Sriram Subramaniam, Maya Topf, Sanja Abbott, Philip R. Baldwin, John M. Berrisford, Gérard Bricogne, Preeti Choudhary, Tristan I. Croll, Radostin Danev, Sai J. Ganesan, Timothy Grant, Aleksandras Gutmanas, Richard Henderson, J. Bernard Heymann, Juha T. Huiskonen, Andrei Istrate, Takayuki Kato, Gabriel C. Lander, Shee-Mei Lok, Steven J. Ludtke, Garib N. Murshudov, Ryan Pye, Grigore D. Pintilie, Jane S. Richardson, Carsten Sachse, Osman Salih, Sjors H. W. Scheres, Gunnar F. Schroeder, Carlos Oscar S. Sorzano, Scott M. Stagg, Zhe Wang, Rangana Warshamanage, John D. Westbrook, Martyn D. Winn, Jasmine Y. Young, Stephen K. Burley, Jeffrey C. Hoch, Genji Kurisu, Kyle Morris, Ardan Patwardhan, Sameer Velankar
Publikováno v:
IUCrJ, Vol 11, Iss 2, Pp 140-151 (2024)
In January 2020, a workshop was held at EMBL-EBI (Hinxton, UK) to discuss data requirements for the deposition and validation of cryoEM structures, with a focus on single-particle analysis. The meeting was attended by 47 experts in data processing, m
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/0e43f020fe4a4894b6f5aa6a5fd3dc2f
Autor:
Surbhi Mundra, Ashish Kabra
Publikováno v:
Biomolecules, Vol 14, Iss 6, p 668 (2024)
Bacterial peptidyl tRNA hydrolase (Pth) or Pth1 emerges as a pivotal enzyme involved in the maintenance of cellular homeostasis by catalyzing the release of peptidyl moieties from peptidyl-tRNA molecules and the maintenance of a free pool of specific
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/fea32a6bbb214f168880ebd6d0512ea1
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Akademický článek
Tento výsledek nelze pro nepřihlášené uživatele zobrazit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.
Autor:
Warr, Wendy A.1 wendy@warr.com
Publikováno v:
Journal of Computer-Aided Molecular Design. Oct2008, Vol. 22 Issue 10, p707-710. 4p.
Autor:
Oliviero Carugo
Publikováno v:
Crystals, Vol 13, Iss 11, p 1560 (2023)
Two non-redundant, high-quality sets of protein X-ray crystal structures from the Protein Data Bank (room temperature, 288–298 K, and low temperature, 95–105 K) were compared to structural predictions conducted using ColabFold/AlphaFold2. In part
Externí odkaz:
https://doaj.org/article/5b820349091c4ab0896876cc57685b9c